MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W306554400 · doi:10.15173/m.v1i21.801

Human V-ATPase a2 P405L Mutation Results in Cutis Laxa by Affecting V-ATPase Assembly and/or Stability

2012· article· en· W306554400 sur OpenAlexaffvenue
Ravi Kumar, A.K. Bhargava, Morris F. Manolson

Notice bibliographique

RevueThe Meducator · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésATPaseCutis laxaMutationV-ATPaseMedicineBiologyEnzymeGeneticsBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cutis Laxa is a genetic disorder in which a patient’s skin becomes loose and inelastic. The autosomal recessive variant of this disorder has been linked to a genetic mutation in vacuolar-type H+-ATPase (V-ATPase). This enzyme contains a cytosolic domain, responsible for hydrolyzing ATP, and a membrane-bound domain that actively transports protons across intracellular and plasma membranes. Proton pumping regulates housekeeping functions inside the cell, resorption of bone, and acidification of urine. A human missense mutation in one of the V-ATPase subunits (a2 P405L) that causes Cutis Laxa was recreated in the yeast V-ATPase to elucidate why a single amino acid change could affect enzyme activity. The mutation recreated in the yeast V-ATPase disrupted activity based on the inability of yeast to acidify their vacuoles. The membrane domain of the mutant V-ATPase was correctly assembled and targeted to the yeast vacuole but the cytosolic domain was not attached explaining why the vacuoles were not acidic. These results suggest that the loss-of-function mutation present in cutis laxa leads to decreased V-ATPase stability and/or assembly. Further experiments will be designed to assess if the mutation results in a conformational defect, and if so, therapeutics assisting in protein folding can be explored. Such therapeutics not only hold promise for cutis laxa, but also for other V-ATPase genetic diseases such as osteopetrosis, distal renal tubular acidosis and male sterility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe MeducatorMême sujetConnective tissue disorders researchTravaux en français237 207