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Enregistrement W3068613985 · doi:10.1109/access.2020.3018028

Novel Coronavirus Cough Database: NoCoCoDa

2020· article· en· W3068613985 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevueIEEE Access · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 diagnosis using AI
Établissements canadiensÉlisabeth Bruyère HospitalBruyèreUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of CanadaAGE-WELL
Mots-clésInterimPandemicDry coughAnnotationInterim analysisSet (abstract data type)Coronavirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The current pandemic associated with the novel coronavirus (COVID-19) presents a new area of research with its own set of challenges. Creating unobtrusive remote monitoring tools for medical professionals that may aid in diagnosis, monitoring and contact tracing could lead to more efficient and accurate treatments, especially in this time of physical distancing. Audio based sensing methods can address this by measuring the frequency, severity and characteristics of the COVID-19 cough. However, the feasibility of accumulating coughs directly from patients is low in the short term. This article introduces a novel database (NoCoCoDa), which contains COVID-19 cough events obtained through public media interviews with COVID-19 patients, as an interim solution. After manual segmentation of the interviews, a total of 73 individual cough events were extracted and cough phase annotation was performed. Furthermore, the COVID-19 cough is typically dry but can present as a more productive cough in severe cases. Therefore, an investigation of cough sub-type (productive vs. dry) of the NoCoCoDa was performed using methods previously published by our research group. Most of the NoCoCoDa cough events were recorded either during or after a severe period of the disease, which is supported by the fact that 77% of the COVID-19 coughs were classified as productive based on our previous work. The NoCoCoDa is designed to be used for rapid exploration and algorithm development, which can then be applied to more extensive datasets and potentially real time applications. The NoCoCoDa is available for free to the research community upon request.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,202
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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