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Enregistrement W3068884712 · doi:10.48550/arxiv.2008.09017

A summary of the prevalence of Genetic Algorithms in Bioinformatics from 2015 onwards

2020· preprint· en· W3068884712 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuearXiv (Cornell University) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueEvolutionary Algorithms and Applications
Établissements canadiensLakehead University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMachine learningAlgorithmComputer scienceArtificial intelligenceField (mathematics)Genetic algorithmSupport vector machineVariety (cybernetics)PopulationData miningMedicineMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In recent years, machine learning has seen an increasing presencein a large variety of fields, especially in health care and bioinformatics.More specifically, the field where machine learning algorithms have found most applications is Genetic Algorithms.The objective of this paper is to conduct a survey of articles published from 2015 onwards that deal with Genetic Algorithms(GA) and how they are used in bioinformatics.To achieve the objective, a scoping review was conducted that utilized Google Scholar alongside Publish or Perish and the Scimago Journal & CountryRank to search for respectable sources. Upon analyzing 31 articles from the field of bioinformatics, it became apparent that genetic algorithms rarely form a full application, instead they rely on other vital algorithms such as support vector machines.Indeed, support vector machines were the most prevalent algorithms used alongside genetic algorithms; however, while the usage of such algorithms contributes to the heavy focus on accuracy by GA programs, it often sidelines computation times in the process. In fact, most applications employing GAs for classification and feature selectionare nearing or at 100% success rate, and the focus of future GA development should be directed elsewhere. Population-based searches, like GA, are often combined with other machine learning algorithms. In this scoping review, genetic algorithms combined with Support Vector Machines were found to perform best. The performance metric that was evaluated most often was accuracy. Measuring the accuracy avoids measuring the main weakness of GAs, which is computational time. The future of genetic algorithms could be open-ended evolutionary algorithms, which attempt to increase complexity and find diverse solutions, rather than optimize a fitness function and converge to a single best solution from the initial population of solutions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,817
Score d'incertitude au seuil0,606

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,148 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle