Extreme Y chromosome polymorphism corresponds to five male reproductive morphs
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Sex chromosomes form once recombination is halted between the X and Y chromosomes. This loss of recombination quickly depletes Y chromosomes of functional content and genetic variation, which is thought to severely limit their potential to generate adaptive diversity. We examined Y diversity in Poecilia parae , where males occur as one of five discrete morphs, all of which shoal together in natural populations where morph frequency has been stable for over 50 years. Each morph utilizes different complex reproductive strategies, and differ dramatically from each other in color, body size, and mating behavior. Remarkably, morph phenotype is passed perfectly from father to son, indicating there are five Y haplotypes segregating in the species, each of which encodes the complex male morph characteristics. Using linked-read sequencing on multiple P. parae females and males of all five morphs from natural populations, we found that the genetic architecture of the male morphs evolved on the Y chromosome long after recombination suppression had occurred with the X. Comparing Y chromosomes between each of the morphs revealed that although the Ys of the three minor morphs that differ predominantly in color are highly similar, there are substantial amounts of unique genetic material and divergence between the Ys of the three major morphs that differ in reproductive strategy, body size and mating behavior. Taken together, our results reveal the extraordinary ability of evolution to overcome the constraints of recombination loss to generate extreme diversity resulting in five discrete Y chromosomes that control complex reproductive strategies. Significance Statement The loss of recombination on the Y chromosome is thought to limit the adaptive potential of this unique genomic region. Despite this, we describe an extraordinary case of Y chromosome adaptation in Poecilia parae . This species contains five co-occurring male morphs, all of which are Y-linked, and which differ in reproductive strategy, body size, coloration, and mating behavior. The five Y-linked male morphs of P. parae evolved after recombination was halted on the Y, resulting in five unique Y chromosomes within one species. Our results reveal the surprising magnitude to which non-recombining regions can generate adaptive diversity and have important implications for the evolution of sex chromosomes and the genetic control of sex-linked diversity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».