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Enregistrement W3073671148 · doi:10.1093/jb/mvaa097

Kinetics and thermodynamics of thermal inactivation for recombinant <i>Escherichia coli</i> cellulases, cel12B, cel8C, and polygalacturonase, peh28; biocatalysts for biofuel precursor production

2020· article· en· W3073671148 sur OpenAlexaff
Eman Ibrahim, Ahmed S. Mahmoud, Kim D. Jones, Keith E. Taylor, Ebtesam N. Hosseney, Patrick L. Mills, Jean Escudero

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Biochemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGibbs free energyChemistryCellulaseLignocellulosic biomassPectinaseThermal stabilityKineticsThermostabilityEscherichia coliCelluloseChemical engineeringBiochemistryThermodynamicsEnzymeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lignocellulosic biomass conversion using cellulases/polygalacturonases is a process that can be progressively influenced by several determinants involved in cellulose microfibril degradation. This article focuses on the kinetics and thermodynamics of thermal inactivation of recombinant Escherichia coli cellulases, cel12B, cel8C and a polygalacturonase, peh 28, derived from Pectobacterium carotovorum sub sp. carotovorum. Several consensus motifs conferring the enzymes' thermal stability in both cel12B and peh28 model structures have been detailed earlier, which were confirmed for the three enzymes through the current study of their thermal inactivation profiles over the 20-80°C range using the respective activities on carboxymethylcellulose and polygalacturonic acid. Kinetic constants and half-lives of thermal inactivation, inactivation energy, plus inactivation entropies, enthalpies and Gibbs free energies, revealed high stability, less conformational change and protein unfolding for cel12B and peh28 due to thermal denaturation compared to cel8C. The apparent thermal stability of peh28 and cel12B, along with their hydrolytic efficiency on a lignocellulosic biomass conversion as reported previously, makes these enzymes candidates for various industrial applications. Analysis of the Gibbs free energy values suggests that the thermal stabilities of cel12B and peh28 are entropy-controlled over the tested temperature range.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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