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Enregistrement W3074157013 · doi:10.21769/bioprotoc.3729

Measuring Cell Growth and Junction Development in Epithelial Cells Using Electric Cell-Substrate Impedance Sensing (ECIS)

2020· article· en· W3074157013 sur OpenAlexafffund
Shaista Anwer, Katalin Szászi

Notice bibliographique

RevueBIO-PROTOCOL · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
Thématique3D Printing in Biomedical Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchKidney Foundation of Canada
Mots-clésTight junctionBarrier functionMaterials scienceElectrical impedanceCell growthElectrodeCapacitanceChemistryOptoelectronicsCell biologyElectrical engineeringBiologyEngineeringBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

, the properties of tight junctions). The method provides simultaneous information on cell number and tight junction function by detecting electric parameters of cells grown on electrodes. Samples are probed with small alternating current (AC) over a range of frequencies, and changes in capacitance and impedance are measured over time. Capacitance reflects the degree of electrode coverage by cells, that correlates with cell number, and can be used to assess cell proliferation or migration. Impedance values inform about barrier function. Obtaining real-time simultaneous information on these parameters is unique to this system and is of great value for addressing fundamental questions such as the role of tight junction proteins in cell growth and migration. This protocol describes the use of ECIS to follow cell growth and tight junction-dependent barrier generation in tubular epithelial cells. We used this method to explore how depleting claudin-2, a tight junction protein affects tubular cell growth and barrier function. During the process, cells are transfected with control or claudin-2-specific siRNA, and 24h later plated on electrodes. ECIS automatically collects information on cell growth and barrier as the monolayer develops. The data are initially analyzed using the ECIS software and exported into a graph software for further processing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,156
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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