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Enregistrement W3080190952 · doi:10.5197/j.2044-0588.2020.042.004

First report of <i>Chrysomyxa ledicola</i> attacking spruce (<i>Picea</i> spp.) in Greenland

2020· article· en· W3080190952 sur OpenAlexaboutno aff
Eigil de Neergaard, Susanne Harding

Notice bibliographique

RevueNew Disease Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBotanyHerbariumHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Small conifer plantations have been established in the Tasermiut, Igaliko and Tunulliarfik fjord regions of South Greenland. In August 2019 spruce trees in an extensive area in a plantation in Kuusuaq (Tasermiut) showed symptoms resembling those of spruce needle rust. The plantation (60° 16‘ N, 44° 43‘ W) was established from 1960 onwards and covers an area of 5.5 ha with mainly Picea glauca, Picea × lutzii, Pinus contorta and Larix sibirica partly mixed, partly planted in blocks/rows. The infection was observed primarily on Picea × lutzii (progeny from a hybrid swarm on the Kenai Peninsula, Alaska). Symptoms included yellowing of the current year's needles, entire branch systems turning yellow to whitish, and needles being covered by aecia with white papery fracturing peridia (Fig. 1). Minor infection was observed on P. glauca with scattered shoots showing symptoms. The most prominent attacks were observed where P. × lutzii was planted in blocks, and in particular where the alternate host Rhododendron groenlandicum (bog Labrador tea) was growing in dense stands amongst the trees. Here, almost all P. lutzii (an area of 1 ha in total) were showing symptoms, even to the tops of the trees (Fig. 2). The pathogen responsible was identified as Chrysomyxa ledicola based on morphological characteristics of the aeciospores: bright orange, globoid, 22-30 μm wide, up to 50 μm long, with a thick hyaline and heavily sculptured wall. The identification was confirmed by ITS rDNA sequence analysis performed by CABI (Surrey, UK). A sample of the collected material was deposited in herbarium C at the University of Copenhagen. To our knowledge, this is the first record of C. ledicola attacking Picea in Greenland. The fungus has, however, previously been observed on R. groenlandicum in Greenland (pers. obs., 1976) in the abscence of Picea spp. Furthermore, this is the first report of this pathogen infecting P. × lutzii. The record is remarkable because of the extent of the observed attack. Widespread infections of Picea spp. are known from Canada and Alaska (Yukon Forest Health, 4; Mulvey, 2). In North America, infection rarely causes mortality but repeated infections may impair growth. It should be noticed that heavy infections of Picea in North America generally do not occur at a distance of more than 300 m from bog Labrador tea (Hennon, 1). In South Greenland, P. × lutzii is considered one of the best adapted conifers, growing vigorously in several plantations, and hence one of the most promising types for forest plantations in Greenland (Normand et al., 3). Therefore, the present record of spruce needle rust should be considered when planning future forest plantations in South Greenland. The authors are grateful to The Agricultural Consulting Services of Greenland for technical support, and Den Grønlandske Fond for financial support.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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