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Enregistrement W3080308817 · doi:10.1101/mcs.a005058

Reciprocal skeletal phenotypes of PRC2-related overgrowth and Rubinstein–Taybi syndromes: potential role of H3K27 modifications

2020· review· en· W3080308817 sur OpenAlexafffund
Daniel Gamu, William T. Gibson

Notice bibliographique

RevueMolecular Case Studies · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BCBC Children's Hospital
Mots-clésPRC2EpigeneticsBiologyHistone H3GeneticsPhenotypeHistoneEZH2AcetylationGene silencingCell biologyCancer researchGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Within histone H3, lysine 27 (H3K27) is one of the residues that functions as a molecular switch, by virtue of being subject to mutually exclusive post-translational modifications that have reciprocal effects on gene expression. Whereas acetylation of H3K27 is associated with transcriptional activation, methylation at this residue causes transcriptional silencing; these two modifications are mutually exclusive. Establishment of these epigenetic marks is important in defining cellular identity and for maintaining normal cell function, as evidenced by rare genetic disorders of epigenetic writers involved in H3K27 post-translational modification. Polycomb repressive complex (PRC2)-related overgrowth and Rubinstein-Taybi syndrome (RSTS) are respectively associated with impaired H3K27 methylation and acetylation. Whereas these syndromes share commonalities like intellectual disability and susceptibility to cancers, they are generally divergent in their skeletal growth phenotypes, potentially through dysregulation of their opposing H3K27 writer functions. In this review, we discuss the requirement of H3K27 modifications for successful embryogenesis, highlighting data from relevant mouse knockout studies. Although such gene ablation studies are integral for defining fundamental biological roles of methyl- and acetyltransferase function in vivo, studies of partial loss-of-function models are likely to yield more meaningful translational insight into progression of PRC2-related overgrowth or RSTS. Thus, modeling of rare human PRC2-related overgrowth and RSTS variants in mice is needed to fully understand the causative role of aberrant H3K27 modification in the pathophysiology of these syndromes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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