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Enregistrement W3080371501 · doi:10.1101/2020.08.18.20177691

Genetically-predicted vitamin D status, ambient UVB during the pandemic and COVID-19 risk in UK Biobank: Mendelian Randomisation study

2020· preprint· en· W3080371501 sur OpenAlexaff
Xue Li, Jos van Geffen, Michiel van Weele, Xiaomeng Zhang, Yazhou He, Xiangrui Meng, Maria Timofeeva, Harry Campbell, Malcolm G. Dunlop, Lina Zgaga, Evropi Τheodoratou

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVitamin D Research Studies
Établissements canadiensCentre for Global Health Research
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCancer Research UK
Mots-clésVitamin D and neurologyConfoundingCoronavirus disease 2019 (COVID-19)BiobankMedicineLogistic regressionInternal medicineEnvironmental healthDemographyBiologyDiseaseBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A growing body of evidence shows that poor vitamin D status has been associated with an increased susceptibility to viral and bacterial respiratory infections. In this study, we aimed to examine the association between vitamin D and COVID-19 risk and outcomes, and to explore potential causal effects. We used logistic regression to identify associations between different vitamin D variables (25-hydroxyvitamin D concentration (25-OHD), ambient UVB and genetically-predicted 25-OHD concentrations) and COVID-19 (risk of infection, hospitalisation and death) in 495,780 participants from UK Biobank. We subsequently performed a Mendelian Randomisation (MR) study to test if there was any causal effect. In total, 1,746 COVID-19 cases and 399 COVID-19 deaths occurred between March and June 2020. We found significant inverse associations between COVID-19 infection and 25-OHD in univariable models, but these associations were non-significant after adjustment for confounders. Ambient UVB was strongly and inversely associated with hospitalization and death. Although the main MR analysis showed that genetically-predicted vitamin D levels were not causally associated with COVID-19 risk, MR sensitivity analysis using weighted mode method indicated a potential causal effect (OR=0.72, 95% CI:0.53-0.98; P=0.041). In conclusion, our study found suggestive evidence of association between vitamin D and the risk or severity of COVID-19 but further studies are needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,069

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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