MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3080378244 · doi:10.1186/s12864-020-06992-2

Candidate stress biomarkers for queen failure diagnostics

2020· article· en· W3080378244 sur OpenAlexafffund
Alison McAfee, Joseph Milone, Abigail Chapman, Leonard J. Foster, Jeffery S. Pettis, David R. Tarpy

Notice bibliographique

RevueBMC Genomics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and AgricultureGenome British ColumbiaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaProject Apis m.Genome CanadaU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyHeat shock proteinShock (circulatory)StressorHeat shockGeneticsMedicineNeuroscienceInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Queen failure is a persistent problem in beekeeping operations, but in the absence of overt symptoms it is often difficult, if not impossible, to ascertain the root cause. Stressors like heat-shock, cold-shock, and sublethal pesticide exposure can reduce stored sperm viability and lead to cryptic queen failure. Previously, we suggested candidate protein markers indicating heat-shock in queens. Here, we further investigate these heat-shock markers and test new stressors to identify additional candidate protein markers. RESULTS: We found that heat-shocking queens for upwards of 1 h at 40 °C was necessary to induce significant changes in the two strongest candidate heat-shock markers, and that relative humidity significantly influenced the degree of activation. In blind heat-shock experiments, we tested the efficiency of these markers at assigning queens to their respective treatment groups and found that one marker was sufficient to correctly assign queens 75% of the time. Finally, we compared cold-shocked queens at 4 °C and pesticide-exposed queens to controls to identify candidate markers for these additional stressors, and compared relative abundances of all markers to queens designated as 'healthy' and 'failing' by beekeepers. Queens that failed in the field had higher expression of both heat-shock and pesticide protein markers, but not cold-shock markers. CONCLUSIONS: This work offers some of the first steps towards developing molecular diagnostic tools to aid in determining cryptic causes of queen failure. Further work will be necessary to determine how long after the stress event a marker's expression remains elevated, and how accurate these markers will be for field diagnoses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,281
Score d'incertitude au seuil0,574

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC GenomicsMême sujetHeat shock proteins researchTravaux en français237 207