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Enregistrement W3080637717 · doi:10.1093/ofid/ofaa371

Real-world Time to Positivity of 2 Widely Used Commercial Blood Culture Systems in Patients With Severe Manifestations of Sepsis: An Analysis of the FABLED Study

2020· article· en· W3080637717 sur OpenAlexafffund
Guillaume Butler‐Laporte, Cédric P. Yansouni, Katryn Paquette, Alexander Lawandi, Sarah Stabler, Murtaza Akhter, Adam C Davidson, Marko Gavric, Rehman Jinah, Zahid A. Saeed, Koray Demir, Sassan Sangsari, Kelly Huang, Amirali Mahpour, Chris Shamatutu, Chelsea Caya, Jean-Marc Troquet, Gregory Clark, Titus Wong, Todd C. Lee, Robert Stenstrom, David Sweet, Matthew P. Cheng

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensVancouver Coastal HealthWestern UniversityMcGill UniversityLions Gate HospitalMcGill University Health CentreInstitute of Infection and ImmunityUniversity of British ColumbiaSurrey Memorial Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéVancouver Coastal Health Research InstituteSt. Paul's Foundation
Mots-clésMedicineBlood cultureInterquartile rangeSepsisProspective cohort studyBacteremiaInternal medicineCohortCohort studyPopulationSurgeryAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Of all microbiological tests performed, blood cultures have the most impact on patient care. Timely results are essential, especially in the management of sepsis. While there are multiple available blood culture systems on the market, they have never been compared in a prospective study in a critically ill population. Methods We performed an analysis of the FABLED study cohort to compare culture results and time to positivity (TTP) of 2 widely used blood culture systems: BacT/Alert and BACTEC. In this multisite prospective study, patients with severe manifestations of sepsis had cultures drawn before antibiotics using systematic enrollment criteria and blood drawing methodology allowing for minimization of pre-analytical biases. Results We enrolled 315 patients; 144 had blood cultures (47 positive) with BacT/Alert and 171 with BACTEC (53 positive). Patients whose blood cultures were processed using the BacT/Alert system were younger (median, 64 vs 70 years; P = .003), had a higher proportion of HIV (9.03% vs 1.75%; P = .008) and a lower qSOFA (P = .003). There were no statistically significant differences in the most commonly identified bacterial species. TTP was shorter for BACTEC (median [interquartile range {IQR}], 12.5 [10–14] hours) compared with BacT/Alert (median [IQR], 17 [14–21] hours; P < .0001). Conclusions In this large prospective multi-centre study comparing the two blood culture systems among patients with severe manifestations of sepsis, and using a rigorous pre-analytical methodology, the BACTEC system yielded positive culture results 4.5 hours earlier than BacT/Alert. These results apply to commonly isolated bacteria. However, our study design did not allow direct comparison of TTP for unusual pathogens nor of clinical sensitivity between systems. More research is needed to determine the clinical implications of this finding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,571

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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