Gut Microbiota Profile in Patients with Type 1 Diabetes Based on 16S rRNA Gene Sequencing: A Systematic Review
Notice bibliographique
Résumé
The gut microbiota has been presumed to have a role in the pathogenesis of type 1 diabetes (T1D). Significant changes in the microbial composition of T1D patients have been reported in several case-control studies. This study is aimed at systematically reviewing the existing literature, which has investigated the alterations of the intestinal microbiome in T1D patients compared with healthy controls (HCs) using 16S ribosomal RNA-targeted sequencing. The databases of MEDLINE, EMBASE, Web of Science, and the Cochrane Library were searched until April 2019 for case-control studies comparing the composition of the intestinal microbiome in T1D patients and HCs based on 16S rRNA gene sequencing techniques. The Newcastle-Ottawa Scale was used to assess the methodological quality. Ten articles involving 260 patients with T1D and 276 HCs were included in this systematic review. The quality scores of all included studies were 6–8 points. In summary, a decreased microbiota diversity and a significantly distinct pattern of clustering with regard to β-diversity were observed in T1D patients when compared with HCs. At the phylum level, T1D was characterised by a reduced ratio of Firmicutes/Bacteroidetes in the structure of the gut community, although no consistent conclusion was reached. At the genus or species level, T1D patients had a reduced abundance of Clostridium and Prevotella compared with HCs, whereas Bacteroides and Ruminococcus were found to be more enriched in T1D patients. This systematic review identified that there is a close association between the gut microbiota and development of T1D. Moreover, gut dysbiosis might be involved in the pathogenesis of T1D, although the causative role of gut microbiota remains to be established. Further well-controlled prospective studies are needed to better understand the role of the intestinal microbiome in the pathogenesis of T1D, which may help explore novel microbiota-based strategies to prevent and treat T1D.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,006 | 0,006 |
| Bibliométrie | 0,010 | 0,010 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».