Quantitative Trait Locus Locating Analysis of Bud Set time in an F1 Hybrid Population of <i>Populus deltoides</i> and <i>Populus simonii</i>
Notice bibliographique
Résumé
Growth and dormancy are the two most important biological processes in the life cycle of perennial plants. Studying dormancy-related traits is of great significance for understanding the adaptability of forest growth and improving the efficiency of plant molecular breeding. In order to reveal the genetic mechanism of poplar bud set, we performed quantitative trait locus (QTL) locating analysis of the trait with the KW method in the software MapQTL, based on the F 1 hybrid population derived from a cross of Populus deltoides and Populus simonii and the two parental linkage maps. As a result, 15 QTLs controlling bud set were identified distributing on 7 linkage groups, among which 12 QTLs were located in linkage groups LG-1, LG-7, LG-9, LG-11 and LG-15 on the maternal P. deltoides map, whereas the other 3 QTLs were distributed in linkage groups LG-9 and LG-12 on the paternal P. simonii map. According to the location of the QTLs on the P. trichocarpa genome, a total of 45 candidate genes for bud set were identified. Furthermore, GO and KEGG enrichment analyses revealed that 71% of the candidate genes possessed potential functions in light and hormone signal transduction pathways. The research results provide a valuable resource for exploring the genes involved with bud set in poplar and for the application in molecular marker-assisted breeding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».