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Enregistrement W3080813269 · doi:10.3390/app10175918

Peak Fitting Applied to Fourier Transform Infrared and Raman Spectroscopic Analysis of Proteins

2020· article· en· W3080813269 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueApplied Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProteins in Food Systems
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRaman spectroscopyAmideChemistryFourier transform infrared spectroscopyAnalytical Chemistry (journal)Protein secondary structureInfraredGlobular proteinInfrared spectroscopyCrystallographyChromatographyPhysicsOpticsOrganic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

FTIR and Raman spectroscopy are often used to investigate the secondary structure of proteins. Focus is then often laid on the different features that can be distinguished in the Amide I band (1600–1700 cm−1) and, to a lesser extent, the Amide II band (1510–1580 cm−1), signature regions for C=O stretching/N-H bending, and N-H bending/C-N stretching vibrations, respectively. Proper investigation of all hidden and overlapping features/peaks is a necessary step to achieve reliable analysis of FTIR and FT-Raman spectra of proteins. This paper discusses a method to identify, separate, and quantify the hidden peaks in the amide I band region of infrared and Raman spectra of four globular proteins in aqueous solution as well as hydrated zein and gluten proteins. The globular proteins studied, which differ widely in terms of their secondary structures, include immunoglobulin G, concanavalin A, lysozyme, and trypsin. Peak finding was done by analysis of the second derivative of the original spectra. Peak separation and quantification was achieved by curve fitting using the Voigt function. Structural data derived from the FT-Raman and FTIR analyses were compared to literature reports on protein structure. This manuscript proposes an accurate method to analyze protein secondary structure based on the amide I band in vibrational spectra.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,170
Score d'incertitude au seuil0,259

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle