Molecular Characterization of Hemorrhagic Enteritis Virus (HEV) Obtained from Clinical Samples in Western Canada 2017–2018
Notice bibliographique
Résumé
Hemorrhagic enteritis virus (HEV) is an immunosuppressive adenovirus that causes an acute clinical disease characterized by hemorrhagic gastroenteritis in 4-week-old turkeys and older. Recurrent incidence of secondary infections (e.g., systemic bacterial infections, cellulitis, and elevated mortality), may be associated with the presence of field-type HEV in Canadian turkey farms. We speculate that field-type HEV and vaccine/vaccine-like strains can be differentiated through analysis of the viral genomes, hexon genes, and the specific virulence factors (e.g., ORF1, E3, and fib knob domain). Nine out of sixteen spleens obtained from cases suspected of immunosuppression by HEV were analyzed. The limited data obtained showed that: (1) field-type HEV circulates in many non-vaccinated western Canadian flocks; (2) field-type HEV circulates in vaccinated flocks with increased recurrent bacterial infections; and (3) the existence of novel point mutations in hexon, ORF1, E3, and specially fib knob domains. This is the first publication showing the circulation of wild-type HEV in HEV-vaccinated flocks in Western Canada, and the usefulness of a novel procedure that allows whole genome sequencing of HEV directly from spleens, without passaging in cell culture or passaging in vivo. Further studies focusing more samples are required to confirm our observations and investigate possible vaccination failure.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».