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Enregistrement W3080867276 · doi:10.1101/2020.08.24.20181016

Mortality from COVID in Colombia and Peru: Analyses of Mortality Data and Statistical Forecasts

2020· preprint· en· W3080867276 sur OpenAlexafffund
Zoë R. Greenwald, Luis E. Salinas, Gabriel Aguirre Martens, Leslie Newcombe, Peter S. Rodriguez, Hellen Gelband, Jérémy Veillard, Prabhat Jha

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensCentre for Global Health ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoWorld Bank Group
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)GeographyMortality rateDemographyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract National predictions of the course of COVID mortality can be used to plan for effective healthcare responses as well as to support COVID policymaking. We developed the Global COVID Assessment of Mortality (GCAM), a statistical model with continually improving precision that combines actual mortality counts with Bayesian inference, to predict COVID trends, currently until December 1, 2020. In Colombia, the GCAM analysis found the peak of COVID mortality around August 12 and an expected total of COVID deaths of 24,000-31,000, or 48%-92% over the total through August 21. In Peru, a first mortality peak occurred around May 24, and given the current trajectory, a second peak is predicted around September 6. Peru can expect 29,000-43,000 COVID deaths, representing an increase of 7%-55% over COVID deaths through August 21. GCAM projections are also used to estimate medical surge capacity needs. To gauge the reliability of COVID mortality forecasts, we compared all-cause mortality from January through June 2020 with average all-cause mortality in previous years in Colombia and Peru, and found that the excesses were consistent with GCAM forecast, most notably a doubling of overall mortality from May 25-June 7 th of weeks in Peru. The GCAM results predict that as a percentage of all adult deaths in previous years, Colombia can expect about 13% excess from COVID deaths, whereas Peru can expect 34% excess. Comparisons of GCAM analyses of several other countries with Colombia and Peru demonstrate the extreme variability that characterizes COVID mortality around the world, emphasizing the need for country-specific analyses and ongoing monitoring as more mortality data become available.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,086
Score d'incertitude au seuil0,172

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,713
Tête enseignante GPT0,552
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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