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Enregistrement W3080957533 · doi:10.7554/elife.58498

Nongenetic inheritance and multigenerational plasticity in the nematode C. elegans

2020· review· en· W3080957533 sur OpenAlexafffund
L. Ryan Baugh, Troy Day

Notice bibliographique

RevueeLife · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPhenotypic plasticityBiologyInheritance (genetic algorithm)Evolutionary biologyPlasticityCaenorhabditis elegansPhenotypeModel organismAdaptive evolutionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A rapidly growing body of literature in several organisms suggests that environmentally-induced adaptive changes in phenotype can be transmitted across multiple generations. Although within-generation plasticity has been well documented, multigenerational plasticity represents a significant departure from conventional evolutionary thought. Studies of C. elegans have been particularly influential because this species exhibits extensive phenotypic plasticity, it is often essentially isogenic, and it has well-documented molecular and cellular mechanisms through which nongenetic inheritance occurs. However, while experimentalists are eager to claim that nongenetic modes of inheritance characterized in this and other model systems enhance fitness, many biologists remain skeptical given the extraordinary nature of this claim. We establish three criteria to evaluate how compelling the evidence for adaptive multigenerational plasticity is, and we use these criteria to critically examine putative cases of it in C. elegans. We conclude by suggesting potentially fruitful avenues for future research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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