Development of Proteomic Prediction Models for Transition to Psychotic Disorder in the Clinical High-Risk State and Psychotic Experiences in Adolescence
Notice bibliographique
Résumé
Importance: Biomarkers that are predictive of outcomes in individuals at risk of psychosis would facilitate individualized prognosis and stratification strategies. Objective: To investigate whether proteomic biomarkers may aid prediction of transition to psychotic disorder in the clinical high-risk (CHR) state and adolescent psychotic experiences (PEs) in the general population. Design, Setting, and Participants: This diagnostic study comprised 2 case-control studies nested within the European Network of National Schizophrenia Networks Studying Gene-Environment Interactions (EU-GEI) and the Avon Longitudinal Study of Parents and Children (ALSPAC). EU-GEI is an international multisite prospective study of participants at CHR referred from local mental health services. ALSPAC is a United Kingdom-based general population birth cohort. Included were EU-GEI participants who met CHR criteria at baseline and ALSPAC participants who did not report PEs at age 12 years. Data were analyzed from September 2018 to April 2020. Main Outcomes and Measures: In EU-GEI, transition status was assessed by the Comprehensive Assessment of At-Risk Mental States or contact with clinical services. In ALSPAC, PEs at age 18 years were assessed using the Psychosis-Like Symptoms Interview. Proteomic data were obtained from mass spectrometry of baseline plasma samples in EU-GEI and plasma samples at age 12 years in ALSPAC. Support vector machine learning algorithms were used to develop predictive models. Results: The EU-GEI subsample (133 participants at CHR (mean [SD] age, 22.6 [4.5] years; 68 [51.1%] male) comprised 49 (36.8%) who developed psychosis and 84 (63.2%) who did not. A model based on baseline clinical and proteomic data demonstrated excellent performance for prediction of transition outcome (area under the receiver operating characteristic curve [AUC], 0.95; positive predictive value [PPV], 75.0%; and negative predictive value [NPV], 98.6%). Functional analysis of differentially expressed proteins implicated the complement and coagulation cascade. A model based on the 10 most predictive proteins accurately predicted transition status in training (AUC, 0.99; PPV, 76.9%; and NPV, 100%) and test (AUC, 0.92; PPV, 81.8%; and NPV, 96.8%) data. The ALSPAC subsample (121 participants from the general population with plasma samples available at age 12 years (61 [50.4%] male) comprised 55 participants (45.5%) with PEs at age 18 years and 61 (50.4%) without PEs at age 18 years. A model using proteomic data at age 12 years predicted PEs at age 18 years, with an AUC of 0.74 (PPV, 67.8%; and NPV, 75.8%). Conclusions and Relevance: In individuals at risk of psychosis, proteomic biomarkers may contribute to individualized prognosis and stratification strategies. These findings implicate early dysregulation of the complement and coagulation cascade in the development of psychosis outcomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».