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Enregistrement W3081061296 · doi:10.1002/humu.24100

Functional analysis and classification of homozygous and hypomorphic ABCA4 variants associated with Stargardt macular degeneration

2020· article· en· W3081061296 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésABCA4BiologyStargardt diseaseMacular degenerationGeneticsGeneOphthalmologyPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stargardt macular degeneration (Stargardt disease 1 [STGD1]) is caused by mutations in the gene encoding ABCA4, an ATP-binding cassette protein that transports N-retinylidene-phosphatidylethanolamine (N-Ret-PE) across photoreceptor membranes. Reduced ABCA4 activity results in retinoid accumulation leading to photoreceptor degeneration. The disease onset and severity vary from severe loss in visual acuity in the first decade to mild visual impairment late in life. We determined the effect of 22 disease-causing missense mutations on the expression and ATPase activity of ABCA4 in the absence and presence of N-Ret-PE. Three classes were identified that correlated with the disease onset in homozygous STGD1 individuals: Class 1 exhibited reduced ABCA4 expression and ATPase activity that was not stimulated by N-Ret-PE; individuals homozygous for these variants had an early disease onset (≤13 years); Class 2 showed reduced ATPase activity with limited stimulation by N-Ret-PE; these correlated with moderate disease onset (14-40 years); and Class 3 displayed high expression and ATPase activity that was strongly activated by N-Ret-PE; these were associated with late disease onset (>40 years). On the basis of our results, we introduce a functionality index for gauging the effect of missense mutations on STGD1 severity. Our studies support the mild phenotype exhibited by the p.Gly863Ala, p.Asn1868Ile, and p.Gly863Ala/p.Asn1868Ile variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,884
Score d'incertitude au seuil0,261

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle