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Enregistrement W3081120155 · doi:10.1101/2020.08.23.263780

Genetically-modified <i>X. laevis</i> indicate distinct roles for prominin-1 and photoreceptor cadherin in outer segment morphogenesis and retinal dystrophy

2020· preprint· en· W3081120155 sur OpenAlexaff
Brittany J. Carr, Paloma Stanar, Orson L. Moritz

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRetinaMorphogenesisNull alleleCell biologyAnatomyRetinalOpsinMutantGeneticsRhodopsinGeneNeuroscienceBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Mutations in prominin-1 ( prom1 ) and photoreceptor cadherin ( cdhr1 ) are associated with inherited retinal degenerative disorders such as retinitis pigmentosa, cone-rod dystrophy, and juvenile macular dystrophy. The proteins encoded by these genes are hypothesized to regulate photoreceptor outer segment disc morphogenesis, but their functions remain unknown. We used CRISPR/Cas9 to generate prom1-, cdhr1- , and prom1 + cdhr1 -null X. laevis and then documented the effects of these mutations on photoreceptor structure and function. Prom1 -null mutations resulted in dysmorphic photoreceptors comprised of overgrown and disorganized disc membranes. Cones were more severely affected than rods; outer segments were elongated and fragmented, and ERG response was impaired. Autofluorescent deposits in the outer segment layer of aging prom1 -null animals indicate that secondary toxic effects to the retina or RPE drive retinal degeneration for this mutation, instead of direct effects on outer segment disc morphogenesis. Cdhr1 -null photoreceptors did not appear grossly dysmorphic, but ultrastructural analysis revealed that some disc membranes were overgrown or aligned vertically within the plasma membrane. Prom1 + cdhr1 -null mutants did not differ significantly from prom1 -null mutants. Our results indicate that neither prom1 nor cdhr1 are necessary for outer segment disc membrane evagination or the membrane fusion event involved in disc sealing. Rather, they are necessary for higher-order organization of the nascent outer segment discs. Prom1 may align and reinforce interactions between the disc leading edges, a function more critical in cone photoreceptors for structural support. Cdhr1 may help to align nascent discs and maintain horizontal disc orientation prior to fusion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,215
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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