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Enregistrement W3081162216 · doi:10.1093/cid/ciaa1236

Mutations in an Aquaglyceroporin as a Proven Marker of Antimony Clinical Resistance in the Parasite <i>Leishmania donovani</i>

2020· article· en· W3081162216 sur OpenAlexfundno aff
Jade-Éva Potvin, Philippe Leprohon, Marine Queffeulou, Shyam Sundar, Marc Ouellette

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCRISPRLeishmania donovaniDrug resistanceGeneBiologyGenome editingLeishmaniasisGeneticsGenomeVirologyVisceral leishmaniasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Antimonial drugs have long been the mainstay to treat visceral leishmaniasis. Their use has been discontinued in the Indian subcontinent because of drug resistance, but they are still clinically useful elsewhere. The goal of this study was to find markers of antimony resistance in Leishmania donovani clinical isolates and validate experimentally their role in resistance. METHODS: The genomes of sensitive and antimony-resistant clinical isolates were sequenced. The role of a specific gene in contributing to resistance was studied by CRISPR-Cas9-mediated gene editing and intracellular drug sensitivity assays. RESULTS: Both gene copy number variations and single nucleotide variants were associated with antimony resistance. A homozygous insertion of 2 nucleotides was found in the gene coding for the aquaglyceroporin AQP1 in both resistant isolates. Restoring the wild-type AQP1 open reading frame re-sensitized the 2 independent resistant isolates to antimonials. Alternatively, editing the genome of a sensitive isolate by incorporating the 2-nucleotide insertion in its AQP1 gene led to antimony-resistant parasites. CONCLUSIONS: Through genomic analysis and CRISPR-Cas9-mediated genome editing we have proven the role of the AQP1 mutations in antimony clinical resistance in L. donovani.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,431
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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