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Enregistrement W3081327297 · doi:10.3389/fbioe.2020.01001

Synergy Screening Identifies a Compound That Selectively Enhances the Antibacterial Activity of Nitric Oxide

2020· article· en· W3081327297 sur OpenAlexfundno aff
Wen Kang Chou, Mathini Vaikunthan, Hendrik V. Schröder, A. James Link, Hahn Kim, Mark P. Brynildsen

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Bioengineering and Biotechnology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsKeio UniversityDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésDetoxification (alternative medicine)VirulenceNitric oxideBacteriaChemistryEnzymeEscherichia coliBiochemistryMicrobiologyBiologyGeneMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antibiotic resistance poses a serious threat to global health. To reinforce the anti-infective arsenal, many novel therapeutic strategies to fight bacterial infections are being explored. Among them, anti-virulence therapies, which target pathways important for virulence, have attracted much attention. Nitric oxide (NO) defense systems have been identified as critical for the pathogenesis of various bacteria, making them an appealing therapeutic target. In this study, we performed chemical screens to identify inhibitors of NO detoxification in Escherichia coli. We found that 2-mercaptobenzothiazole (2-MBT) can potently inhibit cellular detoxification of NO, achieving a level of inhibition that resembled the effect of genetically removing Hmp, the dominant detoxification enzyme under oxygenated conditions. Further analysis revealed that in the presence of NO, 2-MBT impaired the catalysis of Hmp and synthesis of Hmp and other proteins, whereas in its absence there were minimal perturbations to growth and protein synthesis. In addition, by studying the structure-activity relationship of 2-MBT, we found that both sulfur atoms in 2-MBT were vital for its inhibition of NO detoxification. Interestingly, when 2-mercaptothiazole (2-MT), which lacked the benzene ring, was used, differing biological activities were observed, although they too were NO dependent. Specifically, 2-MT could still prohibit NO detoxification, though it did not interfere with Hmp catalysis; rather, it was a stronger inhibitor of protein synthesis and it reduced the transcript levels of hmp, which was not observed with 2-MBT. Overall, these results provide a strong foundation for further exploration of 2-MBT and 2-MT for therapeutic applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil0,570

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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