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Enregistrement W3081539449 · doi:10.1158/1538-7755.disp19-d114

Abstract D114: VIitamin D signaling of immune-related genes in diverse prostate cancer cancer cell lines

2020· article· en· W3081539449 sur OpenAlexaff
Madhavi Bathina, Leanne Woods‐Burnham, Mya Walker, K. Sean Kimbro, Rick A. Kittles

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVitamin D Research Studies
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDU145Vitamin D and neurologyProstate cancerImmune systemCalcitriol receptorCYP24A1vitamin D deficiencyLNCaPInflammationBiologyEndocrinologyInternal medicineCancer researchImmunologyCancerMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract BACKGROUND: African American (AA) men are disproportionately affected by both prostate cancer (PCa) and vitamin D deficiency compared with European American (EA) men. Vitamin D deficiency is linked to increased PCa aggressiveness and mortality. Inflammation also plays an important role in PCa pathogenesis and progression, and expression of immune-related in genes in PCa tissues differs significantly between AAs and EAs. While evidence linking vitamin D and immune response to PCa remains scarce, previous studies demonstrated that vitamin D has anti-inflammatory effects in prostate tissue and mediates immune-related gene expression. Therefore, we hypothesize that vitamin D deficiency in AA men may alter the expression of immune-related genes associated with prostatic inflammation and PCa progression. METHODS: This study examined the effects of vitamin Don the expression of vitamin D- and immune-related genes. Weexposed a racially diverse panel of PCa cell lines—MDA-PCa-2b (AA), RC77T/E (AA), PC3 (EA), 22Rv1 (EA), and DU145 (EA)—to various concentrations (2.5 nM, 10 nM, 50 nM) of 25-hydroxyvitamin D (25(OH)D) and 1,25 dihydroxyvitamin D (1,25(OH)2D) for 24 hours, and quantified transcript levels and protein expression of VDR, RXRa, RXRb, LRP2, CYP27B1, GDF15, GFRAL, TNFa, IL6, IL8, and IGFBP3 with qPCR and immunoblotting. RESULTS:All cell lines expressed basal levels of VDR, RXRa, and RXRbconfirming the function of vitamin D signaling within PCa cells. Of the downstream immune-related genes tested, we observed a trend demonstrating that vitamin D treatment induced the greatest upregulation in either transcript and/or protein levels among the AA PCa cell lines RC77T/E and/or MDA-PCa-2b. In particular, LRP2, GDF15, TNFa, IL6, IL8, and IGFBP3 significantly increased in AA PCa cell lines exposed to either 25(OH)D or 1,25(OH)2D. CONCLUSIONS: These findings provide insight into a potential differential regulation of immune-related pathways by vitamin D in AA men compared to EA men with PCa. Further studies are warranted to better define the immune profile in prostatic tissue in response to vitamin D deficiency in AA men, and the downstream inflammatory effects on the microenvironment and tumor aggressiveness. Citation Format: Madhavi Bathina, Leanne Woods-Burnham, Mya S Walker, K Sean Kimbro, Rick A Kittles. VIitamin D signaling of immune-related genes in diverse prostate cancer cancer cell lines [abstract]. In: Proceedings of the Twelfth AACR Conference on the Science of Cancer Health Disparities in Racial/Ethnic Minorities and the Medically Underserved; 2019 Sep 20-23; San Francisco, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2020;29(6 Suppl_2):Abstract nr D114.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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