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Enregistrement W3081631090 · doi:10.1186/s13223-020-00473-7

Inflammatory cutaneous lesions and pulmonary manifestations in a new patient with autosomal recessive ISG15 deficiency case report

2020· article· en· W3081631090 sur OpenAlexvenueno aff
Guadalupe Buda, Rita Valdéz, Germán Biagioli, Federico Olivieri, Nicolás Affranchino, Carolina Bouso, Vanesa Lotersztein, Dusan Bogunovic, Jacinta Bustamante, Marcelo A. Martí

Notice bibliographique

RevueAllergy Asthma and Clinical Immunology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésISG15PhenotypeExome sequencingCompound heterozygosityGeneUbiquitinMedicineBiologyImmunologyGeneticsBioinformaticsCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Interferon-stimulated gene 15 ( ISG15) was the first ubiquitin-like modifier protein identified that acts by protein conjugation (ISGylation) and is thought to modulate IFN-induced inflammation. Here, we report a new patient from a non-consanguineous Argentinian family, who was followed for recurrent ulcerative skin lesions, cerebral calcifications and lung disease. Whole Exome Sequencing (WES) revealed two novel compound heterozygous variants (c.285del and c.299_312del, NM_005101.4 GRCh37(hg19), both classified as pathogenic according to ACMG criteria) in the ISG15 gene, resulting in a complete deficiency due to disruption of the second ubiquitin domain of the corresponding protein. The clinical phenotype of this patient is unique given the presence of recurrent pulmonary manifestations and the absence of mycobacterial infections, thus resulting in a phenotype distinct from that previously described in patients with biallelic loss-of-function (LOF) ISG15 variants. This case highlights the role of ISG15 as an immunomodulating factor whose LOF variants result in heterogeneous clinical presentations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,265
Score d'incertitude au seuil0,847

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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