MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3081714385 · doi:10.1038/s42003-020-01210-x

Phenome-wide analyses establish a specific association between aortic valve PALMD expression and calcific aortic valve stenosis

2020· article· en· W3081714385 sur OpenAlexafffund
Zhonglin Li, Nathalie Gaudreault, Benoît J. Arsenault, Patrick Mathieu, Yohan Bossé, Sébastien Thériault

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Valve Diseases and Treatments
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université LavalGovernment of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversité Laval
Mots-clésInternal medicineAortic valveAortic valve stenosisCardiologyStenosisMedicineAtrial fibrillationAorta

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calcific aortic valve stenosis (CAVS) is a frequent heart disease with significant morbidity and mortality. Recent genomic studies have identified a locus near the gene PALMD (palmdelphin) strongly associated with CAVS. Here, we show that genetically-determined expression of PALMD in the aortic valve is inversely associated with CAVS, with a stronger effect in women, in a meta-analysis of two large cohorts totaling 2359 cases and 350,060 controls. We further demonstrate the specificity of this relationship by showing the absence of other significant association between the genetically-determined expression of PALMD in 9 tissues and 852 phenotypes. Using genome-wide association studies meta-analyses of cardiovascular traits, we identify a significant colocalized positive association between genetically-determined expression of PALMD in four non-cardiac tissues (brain anterior cingulate cortex, esophagus muscularis, tibial nerve and subcutaneous adipose tissue) and atrial fibrillation. The present work further establishes PALMD as a promising molecular target for CAVS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,733

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,099
Tête enseignante GPT0,399
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCommunications BiologyMême sujetCardiac Valve Diseases and TreatmentsTravaux en français237 207