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Enregistrement W3081716951 · doi:10.1080/2162402x.2020.1792038

An integrated classifier improves prognostic accuracy in non-metastatic gastric cancer

2020· article· en· W3081716951 sur OpenAlexaff
Xiaofang Xing, Shuqin Jia, Yuxin Leng, Qian Wang, Zhongwu Li, Bin Dong, Ting Guo, Xiaojing Cheng, Hong Du, Ying Hu, Qin Feng, Shenyi Lian, Fengming Luan, Xiaoxiao Ma, Zhe Li, Ming Ni, Jiafu Ji

Notice bibliographique

RevueOncoImmunology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastric Cancer Management and Outcomes
Établissements canadiensMD Precision (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCancerClassifier (UML)OncologyInternal medicineArtificial intelligenceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The American Joint Committee on Cancer (AJCC) staging system is insufficiently prognostic for gastric cancer (GC) patients and complementary factors are in urgent need. Here we aimed to develop a comprehensive model, consisting of both immune signatures and cancer signaling molecules, which was expected to accurately improve survival prediction in non-metastatic gastric cancer (GC). We first validated the prognostic value of a combination of 18 immune features and 52 cancer-signaling molecules in The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Gene Expression Omnibus (GEO) database. Then, their expression and distribution were analyzed in consecutive 1180 GC patients using immunohistochemistry. We developed and validated a novel protein-based prognostic classifier using CDH1, an epithelial–mesenchymal transition (EMT) marker, and five immune features (CD3, CD4, CD274, GZMB, and PAX5) by Cox regression model with group LASSO penalty. We observed significant differences in the overall survival of the high- and low-prognostic risk groups (66.8% VS 27.0%, P < .001). A combination of this classifier with age and pTNM stage had better prognostic value than pTNM alone. The model was further validated in both treatment-naive patients and those treated with neoadjuvant chemotherapy. Moreover, GC patients with high-risk score exhibited a favorable prognosis to adjuvant chemotherapy. This integrated classifier could be automatically analyzed and effectively predict survival of GC patients and may provide a new clinically applicable strategy to identify patients who are more likely to benefit from adjuvant chemotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,510
Score d'incertitude au seuil0,693

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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