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Enregistrement W3081752008 · doi:10.1158/1557-3265.ovca19-b17

Abstract B17: Modeling ovarian cancer in mice using in vivo electroporation and CRISPR-mediated genome editing

2020· article· en· W3081752008 sur OpenAlexaff
Keerthana Harwalkar, Katie Teng, Jocelyn Arceneau, Yifan Zhao, Dave Farnell, Matt Ford, Tuyet Nhung Tun Nu, David G. Huntsman, Yojiro Yamanaka

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensCanadian Centre for Applied Research in Cancer ControlSpinal Cord Injury BCMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOvarian cancerBiologyCancer researchMetastasisCancerFallopian tubeSerous fluidOvarian carcinomaElectroporationCarcinogenesisPathologyMedicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ovarian cancer is the fifth largest cause of cancer-related deaths in women. The vast majority of ovarian cancers are epithelial ovarian cancers, and high-grade serous carcinoma (HGSC) is the most common and most lethal epithelial ovarian cancer. In the last 10 years, it has been recognized that the cell of origin of most HGSCs is within the fallopian tube epithelium, instead of the ovarian surface epithelium. However, the early events in disease progression still remain poorly defined, because HGSC is usually diagnosed at advanced stages and there is a lack of proper animal models recapitulating human disease progression. My group has recently developed a unique strategy for generating mouse ovarian cancer models, which is a combination of in vivo fallopian tube electroporation, Cre-mediated lineage tracing and CRISPR-mediated gene modifications. As proof of principle, we generated a highly metastatic HGSC model by targeting four tumor suppressor genes. The female mice targeted these four genes generated ovarian tumors within 5 months after electroporation and peritoneal metastasis within 6 months. After 6 months, ascites formation was observed in two third of those females. Interestingly, similar to human ovarian cancer patients, we observed two metastatic patterns, miliary and nonmiliary. Our unique strategy has several advantages over the current mouse cancer models: 1) high flexibility permitting many gene combinations/modifications and host genetic backgrounds to be tested; 2) control over the size and area of targeted cells (the low-frequency mosaic transfection pattern better recapitulates the sporadic nature of human tumorigenesis); 3) the ability to track genetically modified cells by fluorescent reporters, permitting analysis of tumor initiation and early metastasis; and 4) highly metastatic mouse models with immune competency. Citation Format: Keerthana Harwalkar, Katie Teng, Jocelyn Arceneau, Yifan Zhao, Dave Farnell, Matt Ford, Tuyet Nhung Tun Nu, David Huntsman, Yojiro Yamanaka. Modeling ovarian cancer in mice using in vivo electroporation and CRISPR-mediated genome editing [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Advances in Ovarian Cancer Research; 2019 Sep 13-16, 2019; Atlanta, GA. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2020;26(13_Suppl):Abstract nr B17.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,129
Tête enseignante GPT0,495
Écart entre enseignants0,366 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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