MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3081780751 · doi:10.1016/j.kint.2020.08.007

HLA-D and PLA2R1 risk alleles associate with recurrent primary membranous nephropathy in kidney transplant recipients

2020· article· en· W3081780751 sur OpenAlexfundno aff
Lena Berchtold, Éric Letouzé, Mariam P. Alexander, Guillaume Canaud, Anne-Els van de Logt, Patrick Hamilton, Christiane Mousson, Vincent Vuiblet, Ann M. Moyer, Sylvain Guibert, Petra Mrázová, C. Levi, Valérie Dubois, Josep M. Cruzado, Armando Torres, Manish J. Gandhi, Nadhir Yousfi, Vladimı́r Tesař, Ondřej Viklický, Maryvonne Hourmant, Bruno Moulin, Philippe Rieu, Gabriel Choukroun, Christophe Legendre, Jack F.M. Wetzels, Paul Brenchley, José Ballarín, Hanna Dêbiec, Pierre Ronco

Notice bibliographique

RevueKidney International · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCentre hospitalier régional universitaire de LilleEuropean Research CouncilCentre Hospitalier Universitaire de ToulouseAgence Nationale de la RechercheHôpitaux Universitaires de GenèveNational Institute for Health and Care ResearchCentre Hospitalier Universitaire VaudoisUniversité de Sherbrooke
Mots-clésMedicineHuman leukocyte antigenMembranous nephropathyAlleleKidneyInternal medicineGastroenterologyImmunologyBiologyGeneticsGlomerulonephritisGeneAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recurrence of primary membranous nephropathy after transplantation occurs in up to 44% of patients and is driven by PLA2R antibody. Here, we asked whether genetic determinants could improve risk prediction. First, we sequenced PLA2R1 and HLA-D loci in 248 patients with primary membranous nephropathy and identified two independent single nucleotide polymorphisms (SNPs) at risk for primary membranous nephropathy at each locus. These were rs9271188 (intergenic between HLA-DRB1 and HLA-DQA1,) and rs9275086 (intergenic between HLA-DQB1 and HLA-DQA2) at the HLA-D locus along with rs6726925 and rs13018963 at the PLA2R1 locus. Then we investigated whether primary membranous nephropathy at-risk variants were associated with recurrence in a retrospective cohort of 105 donor-recipient pairs and a replication cohort of 40 pairs. Seven SNPs located between HLA-DRB1 and HLA-DQA1 in linkage disequilibrium with rs9271188, and three SNPs in the PLA2R1 region predicted recurrence when presented by the donor, but not when presented by the recipient. The two SNPs in the HLA-D region most strongly associated with recurrence (rs9271705 and rs9271550) were confirmed in the replication cohort. A genetic risk score based on the two best predictors at each locus (rs9271705, rs9271550, rs17830558, and rs3828323) identified a group of patients with high risk of recurrence. Thus, our results suggest that the graft contributes to recurrence of primary membranous nephropathy through the disease susceptibility HLA-D and PLA2R1 SNPs in an autoimmune milieu. Further studies are needed before implementation of genetic testing for these in donor selection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,598

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueKidney InternationalMême sujetRenal Diseases and GlomerulopathiesTravaux en français237 207