Analysis of total microcystins and nodularins by oxidative cleavage of their ADMAdda, DMAdda, and Adda moieties
Notice bibliographique
Résumé
Microcystins (MCs) and nodularins (NODs) exhibit high structural variability, including modifications of the Adda (3S-amino-9S-methoxy-2S,6,8S-trimethyl-10-phenyldeca-4E,6E-dienoic acid) moiety. Variations include 9-O-desmethylAdda (DMAdda) and 9-O-acetylDMAdda (ADMAdda) which, unless targeted, may go undetected. Therefore, reference standards were prepared of [ADMAdda5]MCs and [DMAdda5]MCs, which were analyzed using multiple approaches. The cross-reactivities of the [DMAdda5]- and [ADMAdda5]MC standards were similar to that of MC-LR when analyzed with a protein phosphatase 2A (PP2A) inhibition assay, but were <0.25% when analyzed with an Adda enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Oxidative cleavage experiments identified compounds that could be used in the analysis of total MCs/NODs in a similar fashion to the 2R-methyl-3S-methoxy-4-phenylbutanoic acid (MMPB) technique. Products from oxidative cleavage of both the 4,5- and 6,7-ene of Adda, DMAdda and ADMAdda were observed, and three oxidation products, one from each Adda variant, were chosen for analysis and applied to three field samples and a Nostoc culture. Results from the oxidative cleavage method for total Adda, DMAdda, and ADMAdda were similar to those from the Adda-ELISA, PP2A inhibition, and LC-MS/MS analyses, except for the Nostoc culture where the Adda-ELISA greatly underestimated microcystin levels. This oxidative cleavage method can be used for routine analysis of field samples and to assess the presence of the rarely reported, but toxic, DMAdda/ADMAdda-containing MCs and NODs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».