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Enregistrement W3081902946 · doi:10.1097/01.tp.0000699720.63874.6a

MITOCHONDRIAL METABOLISM IS PRESERVED FOLLOWING NORMOTHERMIC EX-VIVO KIDNEY PERFUSION OF GRAFTS PROCURED FOLLOWING CARDIAC DEATH

2020· article· en· W3081902946 sur OpenAlexaff
Peter Urbanellis, Caitríona M. McEvoy, Marko Škrtić, Ivan Linares, Dagmar Kollmann, Fabiola Oquendo, Sujani Ganesh, Laura Mazilescu, Manraj Sharma, Darius Bägli, István Mucsi, Anand Ghanekar, Ana Konvalinka, Lisa A. Robinson, Markus Selzner

Notice bibliographique

RevueTransplantation · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscriptomeEx vivoMicroarrayMachine perfusionIn vivoKidneyTransplantationAndrologyMedicineRenal functionPerfusionKidney transplantationCold storageCreatinineGene expressionAutotransplantationBiologyUrologyGeneInternal medicineLiver transplantation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Normothermic ex-vivo kidney perfusion (NEVKP) preservation has demonstrated superior graft outcomes for kidneys procured following donation-after-cardiac death (DCD) over static cold storage (SCS). To determine the mechanisms for this advantage, we compared the transcriptome from both groups through an unbiased genome-wide microarray analysis. Methods: Kidneys from 30kg Yorkshire pigs were subjected to 30min of warm ischemia and then 8hrs of pressure-controlled NEVKP or SCS prior to heterotopic autotransplantation. Renal biopsies were collected on POD3 and RNA transcript expression was determined utilizing the Affymetrix GeneChip® Porcine Gene 1.0 ST Array platform examining over 23,000 transcripts. Gene set enrichment analysis (GSEA) was completed using the Hallmark gene sets and Gene Ontology (GO) pathways. Results: NEVKP-stored grafts demonstrated parameters associated with improved post-transplant graft function including lactate clearance (0hr:10.29+/-0.48mmol/L vs 8hr:1.67+/-0.67mmol/L,n=5,p<0.01), decreasing intra-renal resistance (0hr:1.63+/-0.20mmHg/mL/min vs 8hr:0.41+/-0.13 mmHg/mL/min,n=5,p<0.01), and continuous urine production. Graft function was significantly improved with NEVKP compared to SCS following transplantation with lower peak serum creatinine (POD1:4.0+/-1.15mg/dL vs POD3:12.0+/-0.78mg/dL,n=5,p<0.01) and higher creatinine clearance on POD3 (39.6+/-11.8mL/min vs 2.6+/-0.9ml/min,n=5,p<0.01). GSEA demonstrated 11 Hallmark Gene Sets enriched in NEVKP compared to SCS including sets associated with fatty-acid metabolism and oxidative phosphorylation, while 7 Gene Sets were enriched in SCS compared to NEVKP (FDR-value<0.25,p<0.05). GO analysis demonstrated pathways associated with lipid oxidation/metabolism, the Krebs cycle, and pyruvate metabolism enriched in NEVKP vs SCS (FDR-value<0.05) Conclusions: NEVKP maintained or enriched transcripts of key mitochondrial metabolic pathways compared to SCS in grafts procured following DCD, likely accounting for the improved post-transplant graft function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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Résumé présentoui

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