MITOCHONDRIAL METABOLISM IS PRESERVED FOLLOWING NORMOTHERMIC EX-VIVO KIDNEY PERFUSION OF GRAFTS PROCURED FOLLOWING CARDIAC DEATH
Notice bibliographique
Résumé
Background: Normothermic ex-vivo kidney perfusion (NEVKP) preservation has demonstrated superior graft outcomes for kidneys procured following donation-after-cardiac death (DCD) over static cold storage (SCS). To determine the mechanisms for this advantage, we compared the transcriptome from both groups through an unbiased genome-wide microarray analysis. Methods: Kidneys from 30kg Yorkshire pigs were subjected to 30min of warm ischemia and then 8hrs of pressure-controlled NEVKP or SCS prior to heterotopic autotransplantation. Renal biopsies were collected on POD3 and RNA transcript expression was determined utilizing the Affymetrix GeneChip® Porcine Gene 1.0 ST Array platform examining over 23,000 transcripts. Gene set enrichment analysis (GSEA) was completed using the Hallmark gene sets and Gene Ontology (GO) pathways. Results: NEVKP-stored grafts demonstrated parameters associated with improved post-transplant graft function including lactate clearance (0hr:10.29+/-0.48mmol/L vs 8hr:1.67+/-0.67mmol/L,n=5,p<0.01), decreasing intra-renal resistance (0hr:1.63+/-0.20mmHg/mL/min vs 8hr:0.41+/-0.13 mmHg/mL/min,n=5,p<0.01), and continuous urine production. Graft function was significantly improved with NEVKP compared to SCS following transplantation with lower peak serum creatinine (POD1:4.0+/-1.15mg/dL vs POD3:12.0+/-0.78mg/dL,n=5,p<0.01) and higher creatinine clearance on POD3 (39.6+/-11.8mL/min vs 2.6+/-0.9ml/min,n=5,p<0.01). GSEA demonstrated 11 Hallmark Gene Sets enriched in NEVKP compared to SCS including sets associated with fatty-acid metabolism and oxidative phosphorylation, while 7 Gene Sets were enriched in SCS compared to NEVKP (FDR-value<0.25,p<0.05). GO analysis demonstrated pathways associated with lipid oxidation/metabolism, the Krebs cycle, and pyruvate metabolism enriched in NEVKP vs SCS (FDR-value<0.05) Conclusions: NEVKP maintained or enriched transcripts of key mitochondrial metabolic pathways compared to SCS in grafts procured following DCD, likely accounting for the improved post-transplant graft function.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».