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Enregistrement W3082000960 · doi:10.1101/2020.09.01.278200

Estimating partial body ionizing radiation exposure by automated cytogenetic biodosimetry

2020· preprint· en· W3082000960 sur OpenAlexaffabout
Ben C. Shirley, Joan H.M. Knoll, Jayne Moquet, Elizabeth A. Ainsbury, Pham Ngoc Duy, Farrah Norton, Ruth C. Wilkins, Peter K. Rogan

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensWestern UniversityHealth CanadaCanadian Nuclear LaboratoriesCytodiagnostics (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDicentric chromosomeBiodosimetryIonizing radiationNuclear medicineIrradiationDosimetryRadiationMetaphaseBiologyMedicineChromosomePhysicsOpticsKaryotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose Inhomogeneous exposures to ionizing radiation can be detected and quantified with the Dicentric Chromosome Assay (DCA) of metaphase cells. Complete automation of interpretation of the DCA for whole body irradiation has significantly improved throughput without compromising accuracy, however low levels of residual false positive dicentric chromosomes (DCs) have confounded its application for partial body exposure determination. Materials and Methods We describe a method of estimating and correcting for false positive DCs in digitally processed images of metaphase cells. Nearly all DCs detected in unirradiated calibration samples are introduced by digital image processing. DC frequencies of irradiated calibration samples and those exposed to unknown radiation levels are corrected subtracting this false positive fraction from each. In partial body exposures, the fraction of cells exposed, and radiation dose can be quantified after applying this modification of the contaminated Poisson method. Results Dose estimates of three partially irradiated samples diverged 0.2 to 2.5 Gy from physical doses and irradiated cell fractions deviated by 2.3-15.8% from the known levels. Synthetic partial body samples comprised of unirradiated and 3 Gy samples from 4 laboratories were correctly discriminated as inhomogeneous by multiple criteria. Root mean squared errors of these dose estimates ranged from 0.52 to 1.14 Gy 2 and from 8.1 to 33.3% 2 for the fraction of cells irradiated. Conclusions Automated DCA can differentiate whole-from partial-body radiation exposures and provides timely quantification of estimated whole-body equivalent dose. Biographical Note Ben Shirley M.Sc. is Chief Software Architect, CytoGnomix Inc. Canada; Joan Knoll Ph.D. Dipl.ABMGG, FCCMG is Professor in Pathology and Laboratory Medicine, Schulich School of Medicine and Dentistry, University of Western Ontario, Canada and cofounder, CytoGnomix Inc.; Jayne Moquet Ph.D. is Principal Radiation Protection Scientist in the Cytogenetics Group, Public Health England; Elizabeth Ainsbury Ph.D. is Head, Cytogenetics Group and the Chromosome Dosimetry Service, Public Health England; Pham Ngoc Duy M.Sc. is deputy director of Biotechnology Center, Dalat Nuclear Research Institute, Vietnam; Farrah Norton M.Sc.is Research Scientist and Lead of the Biodosimetry emergency response and research capability at Canadian Nuclear Laboratories; Ruth Wilkins, Ph.D. is Research Scientist and Chief of the Ionizing Radiation Health Sciences Division at Health Canada, Ontario, Canada; and Peter K. Rogan Ph.D. is Professor of Biochemistry and Oncology, Schulich School of Medicine and Dentistry, University of Western Ontario, Canada, and President, CytoGnomix Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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