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Enregistrement W3082018136 · doi:10.1101/2020.08.31.20184481

Pathogenic <i>SPTBN1</i> variants cause a novel autosomal dominant neurodevelopmental syndrome

2020· preprint· en· W3082018136 sur OpenAlexaff
Margot A. Cousin, Keith A. Breau, Blake A. Creighton, Rebecca C. Spillmann, Erin Torti, Sruthi Dontu, Swarnendu Tripathi, Deepa Ajit, Kathryn M. Harper, Michael C. Stankewich, Richard Person, Yue Si, Elizabeth A. Normand, Amy Blevins, Alison S. May, Louise Bier, Vimla S. Aggarwal, Grazia M.S. Mancini, Marjon A. van Slegtenhorst, Kirsten Cremer, Jessica Becker, Hartmut Engels, Stefan Aretz, Jennifer MacKenzie, Eva H. Brilstra, Koen L.I. van Gassen, Richard H. van Jaarsveld, Renske Oegema, Gretchen Parsons, Paul R. Mark, Ingo Helbig, Sarah McKeown, Robert F. Stratton, Benjamin Cogné, Bertrand Isidor, Pilar Cacheiro, Damian Smedley, Helen V. Firth, Tatjana Bierhals, Katja Kloth, Deike Weiss, Cecilia Fairley, Joseph T.C. Shieh, Amy Kritzer, Parul Jayakar, Evangeline C. Kurtz‐Nelson, Raphael Bernier, Tianyun Wang, Evan E. Eichler, Ingrid M.B.H. van de Laar, Allyn McConkie‐Rosell, Marie McDonald, Jennifer L. Kemppainen, Brendan C. Lanpher, Laura Schultz‐Rogers, Lauren Gunderson, Pavel N. Pichurin, Grace Yoon, Michael Zech, Robert Jech, Juliane Winkelmann, Michael T. Zimmermann, Brenda Temple, Sheryl S. Moy, Eric W. Klee, Queenie K.‐G. Tan, Damaris N. Lorenzo

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesCommon FundOffice of Strategic CoordinationNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilCancer Research UKNIH Office of the DirectorIntellectual and Developmental Disabilities Research CenterDepartment of Health and Social CareUniversity of North Carolina at Chapel HillNational Ataxia FoundationNational Institutes of HealthWellcome Trust
Mots-clésSpectrinHaploinsufficiencyBiologyPhenotypeNeuroscienceNeurodevelopmental disorderHypotoniaLoss functionGeneticsGeneCytoskeleton

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract SPTBN1 encodes βII-spectrin, the ubiquitously expressed member of the β-spectrin family that forms micrometer-scale networks associated with plasma membranes. βII-spectrin is abundantly expressed in the brain, where it is essential for neuronal development and connectivity. Mice deficient in neuronal βII-spectrin expression have defects in cortical organization, global developmental delay, dysmorphisms, and behavioral deficiencies of corresponding severity. These phenotypes, while less severe, are observed in haploinsufficient animals, suggesting that individuals carrying heterozygous variants in this gene may also present with measurable compromise of neural development and function. Here we report the identification of heterozygous SPTBN1 variants in 29 individuals who present with global developmental, language and motor delays, mild to severe intellectual disability, autistic features, seizures, behavioral and movement abnormalities, hypotonia, and variable dysmorphic facial features. We show that these SPTBN1 variants lead to loss-of-function, gain-of-function, and dominant negative effects that affect protein stability, disrupt binding to key protein partners, and disturb cytoskeleton organization and dynamics. Our studies define the genetic basis of this new neurodevelopmental syndrome, expand the set of spectrinopathies affecting the brain and neural development, and underscore the critical role of βII-spectrin in the central nervous system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,951
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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