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Enregistrement W3082265250 · doi:10.3390/ijms21176283

Differential Profiles of Gut Microbiota and Metabolites Associated with Host Shift of Plutella xylostella

2020· article· en· W3082265250 sur OpenAlexaff
Feiying Yang, Hafiz Sohaib Ahmed Saqib, Junhui Chen, Qian‐Qian Ruan, Liette Vasseur, Weiyi He, Minsheng You

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect symbiosis and bacterial influences
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesScientific Research Foundation of Graduate School of Fujian Agriculture and Forestry UniversityNational Key Research and Development Program of China
Mots-clésPlutellaBiologyGut floraMetabolomicsHost (biology)Adaptation (eye)BacteriaMidgutKEGGMetabolic pathwayMetabolismZoologyMicrobiologyGeneticsEcologyBiochemistryGeneLarvaBioinformaticsTranscriptomeGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Evolutionary and ecological forces are important factors that shape gut microbial profiles in hosts, which can help insects adapt to different environments through modulating their metabolites. However, little is known about how gut microbes and metabolites are altered when lepidopteran pest species switch hosts. In the present study, using 16S-rDNA sequencing and mass spectrometry-based metabolomics, we analyzed the gut microbiota and metabolites of three populations of Plutella xylostella: one feeding on radish (PxR) and two feeding on peas (PxP; with PxP-1 and PxP-17 being the first and 17th generations after host shift from radish to peas, respectively). We found that the diversity of gut microbes in PxP-17 was significantly lower than those in PxR and PxP-1, which indicates a distinct change in gut microbiota after host shift. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes analysis revealed that the functions of energy metabolism, signal transduction, and xenobiotics biodegradation and metabolism were increased in PxP-17, suggesting their potential roles in host adaptation. Metabolic profiling showed a significant difference in the abundance of gut metabolites between PxR and PxP-17, and significant correlations of gut bacteria with gut metabolites. These findings shed light on the interaction among plants, herbivores, and symbionts, and advance our understanding of host adaptation associated with gut bacteria and metabolic activities in P. xylostella.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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