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Enregistrement W3082288894 · doi:10.3389/fgene.2020.00952

The Association Analysis of GPNMB rs156429 With Clinical Manifestations in Chinese Population With Parkinson's Disease

2020· article· en· W3082288894 sur OpenAlexaboutno aff
Jin Liu, Gen Li, Yixi He, Guiying He, Pingchen Zhang, Xin Shen, Weishan Zhang, Shengdi Chen, Shishuang Cui, Yuyan Tan

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesScience and Technology Commission of Shanghai MunicipalityShanghai Municipal Education CommissionNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésDiseaseParkinson's diseaseChinese populationMedicineAssociation (psychology)PopulationGenetic associationGeneticsBiologyInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismPsychologyEnvironmental healthGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The mechanisms of Parkinson’s disease (PD) include complicated genetic factors. The roles of newly found risk genes need to be further verified among different ethnicities. In a two-stage meta-analysis, single nucleotide polymorphism (SNP) of rs156429 in glycoprotein nonmetastatic melanoma protein B (GPNMB) was reported to be associated with PD. So far clinical studies have focused on association between rs156429 and PD onset, however there is little evidence linking rs156429 with PD symptoms. Objective: This study aimed to investigate the possible association of GPNMB rs156429 with PD manifestations among southeastern Chinese people. Methods: Demographic variables, disease-related factors, and motor and non-motor assessments of 511 PD patients were collected. Polymerase chain reaction (PCR) and SNaPshot technique were used to detect GPNMB rs156429. The associations of rs156429 with PD rating scales and clinical manifestations were analyzed by Kruskal-Wallis test and logistic regression model separately. Results: Kruskal-Wallis test and logistic regression model failed to reveal an association between GPNMB rs156429 and scores from Montreal Cognitive Assessment (MoCA) (p = 0.037; p = 1.000 after correction), and pain symptoms of 511 PD patients (p = 0.008, OR = 0.59, 95% CI = 0.40-0.87, overdominant model after adjustment; p = 0.168 after correction, overdominant model after adjustment). However, further analysis based on genders showed that GPNMB rs156429 might have a trend for being associated with cognitive dysfunction (Mini-Mental State Examination (MMSE), p = 0.064 after correction; MoCA, p = 0.064 after correction) and pain symptoms (p = 0.063 after correction, overdominant model after adjustment) in female PD patients but not male patients. Conclusions: This study revealed that GPNMB rs156429 might have a trend for being associated with cognitive dysfunction and pain symptoms of female PD patients in the southeastern Chinese population. Further studies from a larger sample size are needed to confirm these findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,316

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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