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Enregistrement W3082365723 · doi:10.1016/j.dib.2020.106258

Data on the removal of peroxides from functionalized polyethylene glycol (PEG) and effects on the stability and sensitivity of resulting PEGylated conjugates

2020· article· en· W3082365723 sur OpenAlexafffund
Samuel Babity, Davide Brambilla

Notice bibliographique

RevueData in Brief · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueNeutrophil, Myeloperoxidase and Oxidative Mechanisms
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPolyethylene glycolPEG ratioChemistryConjugateReactive oxygen speciesFluorescenceCyanineBiophysicsPEGylationExtracellularAqueous solutionCombinatorial chemistryPhotochemistryBiochemistryOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cyanine-5 (Cy5) is a fluorescent dye active in the far-red region of the visible spectrum (λex = 646 nm, λem = 662 nm) [1]. While Cy5 displays fluorescence in its oxidized form, it can be readily converted to its non-fluorescent hydrocyanine equivalent (H-Cy5) when exposed to reducing agents. H-Cy5 can then be converted back to its fluorescent oxidized form when exposed to reactive oxygen species (ROS), allowing it to act as a highly sensitive, high wavelength fluorescent ROS sensor [2]. However, H-Cy5 is a small, poorly water-soluble molecule, and is rapidly taken up into cells in vivo, preventing its use for sensing extracellular ROS, which are implicated in inflammation, wound healing, and other processes [3], [4], [5], [6]. A solution to this lies in the conjugation of Cy5 to a polyethylene glycol (PEG) polymer, increasing its solubility [7]. This conjugate (Cy5-PEG) can be reduced to H-Cy5-PEG to allow the highly sensitive detection of ROS in an aqueous extracellular environment. However, after PEG conjugation, a significant decrease in stability and sensitivity is observed, likely owing to the presence of ROS contaminants in commercial samples of PEG. It has been reported that these ROS impurities can be removed from PEG through a simple freeze-drying procedure [8]. Here, we demonstrate that a simple, straightforward method for the purification of PEG can allow the synthesis of a highly functional, water-soluble ROS sensor that could be used for extracellular ROS sensing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,389

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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