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Enregistrement W3082489650 · doi:10.1074/jbc.ra120.013512

The central domain of cardiac ryanodine receptor governs channel activation, regulation, and stability

2020· article· en· W3082489650 sur OpenAlexafffund
Wenting Guo, Bo Sun, John Paul Estillore, Ruiwu Wang, S.R. Wayne Chen

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésRyanodine receptorChemistryBinding siteCaffeineRyanodine receptor 2BiophysicsStereochemistryCrystallographyReceptorBiochemistryBiologyEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Structural analyses identified the central domain of ryanodine receptor (RyR) as a transducer converting conformational changes in the cytoplasmic platform to the RyR gate. The central domain is also a regulatory hub encompassing the Ca 2+ -, ATP-, and caffeine-binding sites. However, the role of the central domain in RyR activation and regulation has yet to be defined. Here, we mutated five residues that form the Ca 2+ activation site and 10 residues with negatively charged or oxygen-containing side chains near the Ca 2+ activation site. We also generated eight disease-associated mutations within the central domain of RyR2. We determined the effect of these mutations on Ca 2+ , ATP, and caffeine activation and Mg 2+ inhibition of RyR2. Mutating the Ca 2+ activation site markedly reduced the sensitivity of RyR2 to Ca 2+ and caffeine activation. Unexpectedly, Ca 2+ activation site mutation E3848A substantially enhanced the Ca 2+ -independent basal activity of RyR2, suggesting that E3848A may also affect the stability of the closed state of RyR2. Mutations in the Ca 2+ activation site also abolished the effect of ATP/caffeine on the Ca 2+ -independent basal activity, suggesting that the Ca 2+ activation site is also a critical determinant of ATP/caffeine action. Mutating residues with negatively charged or oxygen-containing side chains near the Ca 2+ activation site significantly altered Ca 2+ and caffeine activation and reduced Mg 2+ inhibition. Furthermore, disease-associated RyR2 mutations within the central domain significantly enhanced Ca 2+ and caffeine activation and reduced Mg 2+ inhibition. Our data demonstrate that the central domain plays an important role in channel activation, channel regulation, and closed state stability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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