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Enregistrement W3082659312 · doi:10.5376/mpb.2020.11.0014

Functional Analysis of <i>Arabidopsis thaliana</i> Galactinol Synthase <i>AtGolS2</i> in Response to Abiotic Stress

2020· article· en· W3082659312 sur OpenAlexvenueno aff
Yang Shen, Bowei Jia, Jinyu Wang, Xiaoxi Cai, Bingshuang Hu, Yan Wang, Yue Chen, Mingzhe Sun, Xiaoli Sun

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHeilongjiang Bayi Agricultural UniversityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésArabidopsisAbiotic stressArabidopsis thalianaMutantBiologyRaffinoseGeneOsmotic shockBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soil salt-alkalization is one of the adverse factors limiting crop yields. Identification of key salt-alkaline tolerant genes is of great significance for molecular breeding of stress-resistant crops. In this study, a T-DNA insertion Arabidopsis mutant atgols2 showing higher sensitivity to bicarbonate salt-alkaline stress was screened out against NaHCO 3 treatment. Further bioinformatic analysis revealed that the AtGolS2 gene encoded a galactinol synthase, which is a member of the glycosyltransferase family A superfamily. We predicted the protein interaction network of AtGolS2 via SMART online analysis, and found that these AtGolS2 interacting proteins were related to lipid metabolism, galactose biosynthesis and raffinose biosynthesis, and participated in abiotic stress responses. By using the online expression data, we showed that AtGolS2 expression responded to salt, osmotic, drought and ABA stress. PCR amplification by using the three primers method verified the homozygous T-DNA insertion in atgols2. Phenotypic assays further uncovered that atgols2 mutant was more sensitive to high salt, osmotic and ABA stresses than the wild type Arabidopsis. Taken together, results in this study revealed the positive function of AtGolS2 in bicarbonate salt-alkaline, high salt, osmotic and ABA stresses, which will facilitate further research regarding the function and molecular mechanism of the GolS family genes in stress responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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