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Enregistrement W3082778848 · doi:10.1016/j.ebiom.2020.102973

Plasma metabolomic profiles in liver cancer patients following stereotactic body radiotherapy

2020· article· en· W3082778848 sur OpenAlexafffund
Sylvia S. W. Ng, Gun Ho Jang, Irwin J. Kurland, Yunping Qiu, Chandan Guha, Laura A. Dawson

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésHepatocellular carcinomaMedicineTaurineMetabolomicsInternal medicineLiver cancerLipid metabolismGastroenterologyOncologyPathologyBioinformaticsBiologyAmino acidBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Stereotactic body radiotherapy (SBRT) is an effective treatment for hepatocellular carcinoma (HCC). This study sought to identify differentially expressed plasma metabolites in HCC patients at baseline and early during SBRT, and to explore if changes in these metabolites early during SBRT may serve as biomarkers for radiation-induced liver injury and/or tumour response. METHODS: Forty-seven HCC patients were treated with SBRT on previously published prospective trials. Plasma samples were collected at baseline and after one to two fractions of SBRT, and analysed by GC/MS and LC/MS for untargeted and targeted metabolomics profiling, respectively. FINDINGS: Sixty-nine metabolites at baseline and 62 metabolites after one to two fractions of SBRT were differentially expressed, and strongly separated the Child Pugh (CP) B from the CP A HCC patients. These metabolites are associated with oxidative stress and alterations in hepatic cellular metabolism. Differential upregulation of serine, alanine, taurine, and lipid metabolites early during SBRT from baseline was noted in the HCC patients who demonstrated the greatest increase in CP scores at three months post SBRT, suggesting that high protein and lipid turnover early during SBRT may portend increased clinical liver toxicity. Twenty annotated metabolites including fatty acids, glycerophospholipids, and acylcarnitines were differentially upregulated early during SBRT from baseline and separated patients with complete/partial response from those with stable disease at three months post SBRT. INTERPRETATION: Dysregulation of amino acid and lipid metabolism detected early during SBRT are associated with subsequent clinical liver injury and tumour response in HCC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,628
Score d'incertitude au seuil0,632

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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