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Enregistrement W3082813278 · doi:10.3390/biomedicines8090311

Exploring the Role of Gut Microbiota in Major Depressive Disorder and in Treatment Resistance to Antidepressants

2020· article· en· W3082813278 sur OpenAlexaff
Andrea Fontana, Mirko Manchia, Concetta Panebianco, Pasquale Paribello, Carlo Arzedi, Eleonora Cossu, Mario Garzilli, Maria Antonietta Montis, Andrea Mura, Claudia Pisanu, Donatella Congiu, Massimiliano Copetti, Federica Pinna, Bernardo Carpiniello, Alessio Squassina, Valerio Pazienza

Notice bibliographique

RevueBiomedicines · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesMinistero dell'Università e della RicercaMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaMinistero della Salute
Mots-clésMajor depressive disorderDysbiosisGut floraProteobacteriaActinobacteriaMetagenomicsBiologyInternal medicineMedicineBacteriaGeneticsGeneImmunology16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Major depressive disorder (MDD) is a common severe psychiatric illness, exhibiting sub-optimal response to existing pharmacological treatments. Although its etiopathogenesis is still not completely understood, recent findings suggest that an altered composition of the gut microbiota might play a role. Here we aimed to explore potential differences in the composition of the gut microbiota between patients with MDD and healthy controls (HC) and to identify possible signatures of treatment response by analyzing two groups of MDD patients characterized as treatment-resistant (TR) or responders (R) to antidepressants. Stool samples were collected from 34 MDD patients (8 TR, 19 R and 7 untreated) and 20 HC. Microbiota was characterized using the 16S metagenomic approach. A penalized logistic regression analysis algorithm was applied to identify bacterial populations that best discriminate the diagnostic groups. Statistically significant differences were identified for the families of Paenibacillaceae and Flavobacteriaceaea, for the genus Fenollaria, and the species Flintibacter butyricus, Christensenella timonensis, and Eisenbergiella massiliensis among others. The phyla Proteobacteria, Tenericutes and the family Peptostreptococcaceae were more abundant in TR, whereas the phylum Actinobacteria was enriched in R patients. Moreover, a number of bacteria only characterized the microbiota of TR patients, and many others were only detected in R. Our results confirm that dysbiosis is a hallmark of MDD and suggest that microbiota of TR patients significantly differs from responders to antidepressants. This finding further supports the relevance of an altered composition of the gut microbiota in the etiopathogenesis of MDD, suggesting a role in response to antidepressants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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