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Enregistrement W3082822457 · doi:10.1161/circgen.119.002871

Heterozygous <i>ABCG5</i> Gene Deficiency and Risk of Coronary Artery Disease

2020· article· en· W3082822457 sur OpenAlexaff
Akihiro Nomura, Connor A. Emdin, Hong‐Hee Won, Gina M. Peloso, Pradeep Natarajan, Diego Ardissino, John Danesh, Heribert Schunkert, Adolfo Correa, Matthew J. Bown, Nilesh J. Samani, Jeanette Erdmann, Ruth McPherson, Hugh Watkins, Danish Saleheen, Roberto Elosúa, Masa‐aki Kawashiri, Hayato Tada, Namrata Gupta, Svati H. Shah, Daniel J. Rader, Stacey Gabriel, Amit V. Khera, Sekar Kathiresan

Notice bibliographique

RevueCirculation Genomic and Precision Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteBritish Heart FoundationNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésFamilial hypercholesterolemiaInternal medicineBiologyEndocrinologyMedicineCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Familial sitosterolemia is a rare Mendelian disorder characterized by hyperabsorption and decreased biliary excretion of dietary sterols. Affected individuals typically have complete genetic deficiency—homozygous loss-of-function (LoF) variants—in the ABCG5 or ABCG8 genes and have substantially elevated plasma sitosterol and LDL (low-density lipoprotein) cholesterol (LDL-C) levels. The impact of partial genetic deficiency of ABCG5 or ABCG8 —as occurs in heterozygous carriers of LoF variants—on LDL-C and risk of coronary artery disease (CAD) has remained uncertain. Methods: We first recruited 9 sitosterolemia families, identified causative LoF variants in ABCG5 or ABCG8 , and evaluated the associations of these ABCG5 or ABCG8 LoF variants with plasma phytosterols and lipid levels. We next assessed for LoF variants in ABCG5 or ABCG8 in CAD cases (n=29 321) versus controls (n=357 326). We tested the association of rare LoF variants in ABCG5 or ABCG8 with blood lipids and risk for CAD. Rare LoF variants were defined as protein-truncating variants with minor allele frequency &lt;0.1% in ABCG5 or ABCG8 . Results: In sitosterolemia families, 7 pedigrees harbored causative LoF variants in ABCG5 and 2 pedigrees in ABCG8 . Homozygous LoF variants in either ABCG5 or ABCG8 led to marked elevations in sitosterol and LDL-C. Of those sitosterolemia families, heterozygous carriers of ABCG5 LoF variants exhibited increased sitosterol and LDL-C levels compared with noncarriers. Within large-scale CAD case-control cohorts, prevalence of rare LoF variants in ABCG5 and in ABCG8 was ≈0.1% each. ABCG5 heterozygous LoF variant carriers had significantly elevated LDL-C levels (25 mg/dL [95% CI, 14–35]; P =1.1×10 −6 ) and were at 2-fold increased risk of CAD (odds ratio, 2.06 [95% CI, 1.27–3.35]; P =0.004). By contrast, ABCG8 heterozygous LoF carrier status was not associated with increased LDL-C or risk of CAD. Conclusions: Although familial sitosterolemia is traditionally considered as a recessive disorder, we observed that heterozygous carriers of an LoF variant in ABCG5 had significantly increased sitosterol and LDL-C levels and a 2-fold increase in risk of CAD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,309
Score d'incertitude au seuil0,466

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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