Decoupled richness of generalist anaerobes and sulphate‐reducing bacteria is driven by <scp>pH</scp> across land uses in temperate soils
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Sulphate‐reducing bacteria (SRB) represent a key biological component of the global sulphur (S) cycle and are common in soils, where they reduce SO 4 2− to H 2 S during the anaerobic degradation of soil organic matter. The factors that regulate their distribution in soil, however, remain poorly understood. We sought to determine the ecological patterns of SRB richness within a nationwide 16S metabarcoding dataset. Across 436 sites belonging to seven contrasting temperate land uses (e.g., arable, grasslands, woodlands, heathland and bog), SRB richness was relatively low across land uses but greatest in grasslands and lowest in woodlands and peat‐rich soils. There was a shift in dominant SRB taxa from Desulfosporosinus and Desulfobulbus in arable and grassland land uses to Desulfobacca in heathland and bog sites. In contrast, richness of other generalist anaerobic bacterial taxa found in our dataset (e.g., Clostridium , Geobacter and Pelobacter ) followed a known trend of declining richness linked to land‐use productivity. Overall, the richness of SRBs and anaerobes had strong positive correlations with pH and sulphate concentration and strong negative relationships with elevation, soil organic matter, total carbon and carbon‐to‐nitrogen ratio. It is likely that these results reflect the driving influence of pH and competition for optimal electron acceptors with generalist anaerobic bacteria on SRB richness. Highlights Sulphate‐reducing bacteria (SRB) are key but rare soil biota that may compete with other anaerobes As UK sulphur deposition rates fall, local populations of SRB may also decline in soils Sulphate concentrations were higher in arable and wooded sites, not at higher elevation as expected SRB richness was lower than generalist anaerobes, with peaks in grasslands and a drop in lowland woods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».