Abstract 5425: Novel molecular subtypes identified in prostate cancer: Results from the SPARTAN study
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Results from SPARTAN, a phase III placebo (PBO)-controlled study in patients (pts) with nonmetastatic castration-resistant prostate cancer (nmCRPC), show that apalutamide (APA) plus ongoing androgen deprivation therapy (ADT) significantly improves metastasis-free survival (MFS) compared with PBO + ADT. This analysis investigated the effects of APA in biologically distinct molecular subclasses of prostate cancer defined by gene expression profiles. Methods: Gene expression profiles (DECIPHER® prostate test, San Diego, CA) were generated from 233 archival primary prostate tumors; data were summarized based on 160 predefined gene signatures indicative of clinical prognosis and prostate cancer-related biology. Unsupervised consensus clustering identified sets of co-regulated expression signatures, and associations between signature expression, treatment, and signature-treatment interaction with MFS were evaluated using Kaplan-Meier analysis and Cox proportional hazards models. Results: Four co-regulated expression signature classes, each with distinct biological pathway functions, were identified. Class C1 included prognosis-related (risk) signatures; C2 included steroid homeostasis-related signatures; C3 included hormonal therapy nonresponsive basal and neuroendocrine-like signatures; C4 included immune and stromal signatures. Increased C1 expression was associated with shorter MFS in the PBO group (HR [95% CI], 2.18 [1.11-4.28], p = 0.02), while it was associated with longer MFS in the APA group (interaction HR [95% CI], APA vs PBO, 0.36 [0.14-0.95], p = 0.04). Similarly, increased C2 expression was associated with shorter MFS in the PBO group (HR [95% CI], 1.42 [1.02-1.98], p = 0.04), while it was associated with longer MFS in the APA group (interaction HR [95% CI], APA vs PBO, 0.57 [0.35-0.93], p = 0.02). Although there is no significant interaction effect between signature and treatment in C3, pts with low expression of C3 (adeno-like) showed longer MFS on APA vs PBO (HR [95% CI], 0.23 [0.13-0.40], p < 0.0001) compared with high-C3-expressing neuroendocrine-like tumors. Increased C4 expression was associated with decreased risk of metastasis in the APA group (HR [95% CI], 0.55 [0.35-0.86], p = 0.008) compared with PBO (interaction HR [95% CI], APA vs PBO, 0.53 [0.28-0.98], p = 0.04). Conclusion: Expression signatures were clustered into 4 correlated unique biological subclasses. Clinical benefit of APA + ADT was observed in pts with expression profiles with high risk (C1), C2, C3, or C4 compared with PBO + ADT. Citation Format: Clemente Aguilar, Michael Gormley, Shibu Thomas, Paul N. Mainwaring, David Olmos, Fred Saad, Simon Chowdhury, Elai Davicioni, Yang Liu, Deborah S. Ricci, Angela Lopez-Gitlitz, Margaret K. Yu, Matthew R. Smith, Eric J. Small, Felix Feng. Novel molecular subtypes identified in prostate cancer: Results from the SPARTAN study [abstract]. In: Proceedings of the Annual Meeting of the American Association for Cancer Research 2020; 2020 Apr 27-28 and Jun 22-24. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(16 Suppl):Abstract nr 5425.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».