MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3083567215 · doi:10.21037/qims-20-722

Towards virtual biopsies of gastrointestinal tissues using photoacoustic remote sensing microscopy

2020· article· en· W3083567215 sur OpenAlexaff
Benjamin R. Ecclestone, Saad Abbasi, Kevan Bell, Deepak Dinakaran, Gilbert Bigras, John R. Mackey, Parsin Haji Reza

Notice bibliographique

RevueQuantitative Imaging in Medicine and Surgery · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiquePhotoacoustic and Ultrasonic Imaging
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhotoacoustic imaging in biomedicineVirtual microscopyMicroscopyComputer sciencePathologyMedicineOpticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract: Gastrointestinal (GI) tissue biopsies provide critical diagnostic information for a wide variety of conditions such as neoplastic diseases (colorectal, small bowel and stomach cancers) and non-neoplastic diseases (inflammatory disorders, infection, celiac disease). Endoscopic biopsies collect small tissue samples that require resource intensive processing to permit histopathological analysis. Unfortunately, the sparsely collected biopsy samples may fail to capture the pathologic condition because selection of biopsy sites relies on macroscopic superficial tissue features and clinician judgement. Here, we present the first all-optical non-contact label-free non-interferometric photoacoustic microscopy system capable of performing “virtual biopsies”. A modular photoacoustic remote sensing (PARS™) architecture is used facilitating imaging of unprocessed tissues providing information similar to conventional histopathological staining techniques. Prospectively this would allow gastroenterologists to assess subcellular tissue morphology in situ when selecting biopsy location. Tested on preserved unstained human and freshly resected murine tissues, the presented PARS microscope rapidly retrieves images of similar area to current biopsies, while maintaining comparable quality to the current standard for histopathological analysis. Additionally, results show the first label free assessment of subsurface cellular morphology in FFPE GI tissue blocks. Clinically relevant features are recovered including cellular details such as lamina propria within colon tissue and cell nuclear structure in resected smooth muscle. Constructed with a modular architecture, this system facilitates the future development of compact imaging heads. The modular PARS system overcomes many of the challenges with imaging unstained thick tissue in situ, representing a significant milestone in the development of a clinical microscope providing virtual biopsy capabilities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,971
Score d'incertitude au seuil0,910

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueQuantitative Imaging in Medicine and SurgeryMême sujetPhotoacoustic and Ultrasonic ImagingTravaux en français237 207