Abstract 707: Combinatorial assessment of ctDNA release and mutational burden predicts clinical outcome from anti-PD-(L)1 therapies in non-small-cell lung cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Blood-based detection of circulating tumor DNA (ctDNA) is a non-invasive and clinical accessible source of biomarkers that enables selection of non-small-cell lung cancer (NSCLC) patients for treatment with anti-PD-(L)1 therapies. However, new approaches are necessary to improve enrichment of responders. Patients and Methods: Pretreatment plasma ctDNA from 97 advanced-stage NSCLC patients who underwent anti-PD-(L)1 therapy from December 2015 to August 2017, with matched tissue samples from 66 patients, were profiled using a targeted next-generation sequencing (NGS) panel (Geneseeq) encompassing 422 cancer-relevant genes. External validation was performed using two large randomized trials, POPLAR and OAK. Results: In the 72 patients with adequate ctDNA release (maximum somatic allele frequency, MSAF ≥2%), high blood tumor mutational burden (bTMB) was associated with significantly prolonged median PFS (110 vs 60 days, HR=0.54 [95%CI, 0.31-0.92]; log-rank p = 0.02) and a trend towards improved DCB (34.8% vs 22.5%, p=0.39). While a high concordance was observed between bTMB and tTMB (Spearman's ρ= 0.71), the greatest progression-free survival (PFS) improvement was achieved with concomitantly high bTMB and tTMB (mPFS, 156 vs 59 days, HR=0.47 [95%CI, 0.24-0.91], log-rank p=0.02). Remarkably, the subset of patients with low ctDNA release (MSAF<2%), and consequently non-evaluable bTMB, derived similar PFS benefit as those with high bTMB. The additive predictive value of MSAF and bTMB was externally validated by results from the two large randomized trials. Conclusions: Our findings validated panel-assessed bTMB as a promising biomarker that demonstrated added value over tissue testing alone for benefit with anti-PD-(L)-1 therapies. Our findings also provided the first clinical evidence suggesting that matched tissue and blood testing might be necessary to refine the predictive value of TMB. Moreover, we identified low ctDNA MSAF as an important and robust predictor of improved immunotherapy outcome. Citation Format: Wenfeng Fang, Yuxiang Ma, Jiani C. Yin, Huaqiang Zhou, Fufeng Wang, Hua Bao, Ao Wang, Xue Wu, Shaodong Hong, Yunpeng Yang, Yan Huang, Hongyun Zhao, Yang W. Shao, Li Zhang. Combinatorial assessment of ctDNA release and mutational burden predicts clinical outcome from anti-PD-(L)1 therapies in non-small-cell lung cancer [abstract]. In: Proceedings of the Annual Meeting of the American Association for Cancer Research 2020; 2020 Apr 27-28 and Jun 22-24. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(16 Suppl):Abstract nr 707.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».