Global root traits (GRooT) database
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Motivation Trait data are fundamental to the quantitative description of plant form and function. Although root traits capture key dimensions related to plant responses to changing environmental conditions and effects on ecosystem processes, they have rarely been included in large‐scale comparative studies and global models. For instance, root traits remain absent from nearly all studies that define the global spectrum of plant form and function. Thus, to overcome conceptual and methodological roadblocks preventing a widespread integration of root trait data into large‐scale analyses we created the Global Root Trait (GRooT) Database. GRooT provides ready‐to‐use data by combining the expertise of root ecologists with data mobilization and curation. Specifically, we (a) determined a set of core root traits relevant to the description of plant form and function based on an assessment by experts, (b) maximized species coverage through data standardization within and among traits, and (c) implemented data quality checks. Main types of variables contained GRooT contains 114,222 trait records on 38 continuous root traits. Spatial location and grain Global coverage with data from arid, continental, polar, temperate and tropical biomes. Data on root traits were derived from experimental studies and field studies. Time period and grain Data were recorded between 1911 and 2019. Major taxa and level of measurement GRooT includes root trait data for which taxonomic information is available. Trait records vary in their taxonomic resolution, with subspecies or varieties being the highest and genera the lowest taxonomic resolution available. It contains information for 184 subspecies or varieties, 6,214 species, 1,967 genera and 254 families. Owing to variation in data sources, trait records in the database include both individual observations and mean values. Software format GRooT includes two csv files. A GitHub repository contains the csv files and a script in R to query the database.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,007 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,018 | 0,017 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».