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Enregistrement W3084013747 · doi:10.1101/2020.09.09.288993

Dissecting the heterogeneous subcortical brain volume of Autism spectrum disorder (ASD) using community detection

2020· preprint· en· W3084013747 sur OpenAlexfundno aff
Ting Li, Martine Hoogman, Nina Roth Mota, Jan K. Buitelaar, Alejandro Arias Vásquez, Barbara Franke, Daan van Rooij

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFP7 HealthInstituto de Salud Carlos IIIMedical Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchInnovative Medicines InitiativeCentro de Investigación Biomédica en Red de Salud MentalChina Scholarship CouncilNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekKing's College LondonMinisterio de Ciencia e InnovaciónNational Institute for Health and Care ResearchEuropean Regional Development FundU.S. Department of DefenseEuropean CommissionAlva FoundationAutism SpeaksEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsOntario Brain InstituteFondation Brain CanadaFundación Alicia KoplowitzSouth London and Maudsley NHS Foundation Trust
Mots-clésAutism spectrum disorderPsychologyHomogeneousAutismExploratory factor analysisBrain sizeClinical psychologyDevelopmental psychologyAudiologyMedicineMagnetic resonance imagingPsychometrics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Structural brain alterations found in Autism Spectrum Disorder (ASD) have previously been very heterogeneous, with overall limited effect sizes for every region implicated. In this study, we aimed at exploring the existence of subgroups in ASD, based on neuroanatomic profiles; we hypothesized that effect sizes of case/control difference would be increased in defined subgroups. Using the dataset from the ENIGMA-ASD Working Group (n=2661), exploratory factor analysis (EFA) was applied on seven subcortical volumes of individuals with ASD and controls to uncover the underlying organization of subcortical structures. Based on earlier findings in ADHD patients and controls as well as data availability, we focused on three age groups: boys (aged 4-14 years), male adolescents (aged 14-22 years), and adult men (aged >=22 years). The resulting factor scores were used in a community detection (CD) analysis, to cluster participants into subgroups. Three factors were found in each sample, with the factor structure in adult men differing from that in boys and male adolescents. From the patterns in these factors, CD uncovered four distinct communities in boys and three communities in adolescents and adult men, irrespective of ASD diagnostic status. The effect sizes of case/control comparisons appeared more pronounced than in the whole sample in some communities. Based on subcortical volumes, we succeeded in stratifying our participants into more homogeneous subgroups with similar brain structural patterns. The stratification enhanced our ability to observe case/control differences of subcortical brain volumes in ASD, and may help explain some of the heterogeneity of previous findings in ASD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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