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Enregistrement W3084031290 · doi:10.1101/2020.09.09.290296

Modeling the hemodynamic response function using simultaneous EEG-fMRI data and convolutional sparse coding analysis with rank-1 constraints

2020· preprint· en· W3084031290 sur OpenAlexafffund
Prokopis C. Prokopiou, Michalis Kassinopoulos, Alba Xifra‐Porxas, Marie‐Hélène Boudrias, Georgios D. Mitsis

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensJewish Rehabilitation HospitalMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésResting state fMRIElectroencephalographyAmplitudeComputer scienceNeurophysiologyDeconvolutionSIGNAL (programming language)Artificial intelligencePattern recognition (psychology)PreprocessorNeurosciencePsychologyPhysicsAlgorithm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Over the last few years, an increasing body of evidence points to the hemodynamic response function as an important confound of resting-state functional connectivity. Several studies in the literature proposed using blind deconvolution of resting-state fMRI data to retrieve the HRF, which can be subsequently used for hemodynamic deblurring. A basic hypothesis in these studies is that relevant information of the resting-state brain dynamics is condensed in discrete events resulting in large amplitude peaks in the BOLD signal. In this work, we showed that important information of resting-state activity, in addition to the larger amplitude peaks, is also concentrated in lower amplitude peaks. Moreover, due to the strong effect of physiological noise and head motion on the BOLD signal, which in many cases may not be completely removed after preprocessing, the neurophysiological origin of the large amplitude BOLD signal peaks is questionable. Hence, focusing on the large amplitude BOLD signal peaks may yield biased HRF estimates. To define discrete events of neuronal origins, we proposed using simultaneous EEG-fMRI along with convolutional sparse coding analysis. Our results suggested that events detected in the EEG are able to describe the slow oscillations of the BOLD signal and to obtain consistent HRF shapes across subjects under both task-based and resting-state conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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