Novel dominant MPAN family with a complex genetic architecture as a basis for phenotypic variability
Notice bibliographique
Résumé
Objective Our aim was to study a Hungarian family with autosomal dominantly inherited neurodegeneration with brain iron accumulation (NBIA) with markedly different intrafamilial expressivity. Methods Targeted sequencing and multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) of known NBIA-associated genes were performed in many affected and unaffected members of the family. In addition, a trio whole-genome sequencing was performed to find a potential explanation of phenotypic variability. Neuropathologic analysis was performed in a single affected family member. Results The clinical phenotype was characterized by 3 different syndromes—1 with rapidly progressive dystonia-parkinsonism with cognitive deterioration, 1 with mild parkinsonism associated with dementia, and 1 with predominantly psychiatric symptoms along with movement disorder. A heterozygous stop-gain variation in the C19Orf12 gene segregated with the phenotype. Targeted sequencing of all known NBIA genes, and MLPA of PLA2G6 and PANK2 genes, as well as whole-genome sequencing in a trio from the family, revealed a unique constellation of oligogenic burden in 3 NBIA-associated genes (C19Orf12 p.Trp112Ter, CP p.Val105PhefsTer5, and PLA2G6 dup(ex14)). Neuropathologic analysis of a single case (39-year-old man) showed a complex pattern of alpha-synucleinopathy and tauopathy, both involving subcortical and cortical areas and the hippocampus. Conclusions Our study expands the number of cases reported with autosomal dominant mitochondrial membrane protein-associated neurodegeneration and emphasizes the complexity of the genetic architecture, which might contribute to intrafamilial phenotypic variability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».