MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3084271221 · doi:10.1212/nxg.0000000000000515

Novel dominant MPAN family with a complex genetic architecture as a basis for phenotypic variability

2020· article· en· W3084271221 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNeurology Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurological diseases and metabolism
Établissements canadiensOccupational Cancer Research CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyParkinsonismPhenotypeGeneticsNeurodegenerationMultiplex ligation-dependent probe amplificationTauopathyGenetic architectureGenePathologyMedicineDiseaseExon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3>Objective</h3> Our aim was to study a Hungarian family with autosomal dominantly inherited neurodegeneration with brain iron accumulation (NBIA) with markedly different intrafamilial expressivity. <h3>Methods</h3> Targeted sequencing and multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) of known NBIA-associated genes were performed in many affected and unaffected members of the family. In addition, a trio whole-genome sequencing was performed to find a potential explanation of phenotypic variability. Neuropathologic analysis was performed in a single affected family member. <h3>Results</h3> The clinical phenotype was characterized by 3 different syndromes—1 with rapidly progressive dystonia-parkinsonism with cognitive deterioration, 1 with mild parkinsonism associated with dementia, and 1 with predominantly psychiatric symptoms along with movement disorder. A heterozygous stop-gain variation in the <i>C19Orf12</i> gene segregated with the phenotype. Targeted sequencing of all known NBIA genes, and MLPA of <i>PLA2G6</i> and <i>PANK2</i> genes, as well as whole-genome sequencing in a trio from the family, revealed a unique constellation of oligogenic burden in 3 NBIA-associated genes (<i>C19Orf12</i> p.Trp112Ter, <i>CP</i> p.Val105PhefsTer5, and <i>PLA2G6</i> dup(ex14)). Neuropathologic analysis of a single case (39-year-old man) showed a complex pattern of alpha-synucleinopathy and tauopathy, both involving subcortical and cortical areas and the hippocampus. <h3>Conclusions</h3> Our study expands the number of cases reported with autosomal dominant mitochondrial membrane protein-associated neurodegeneration and emphasizes the complexity of the genetic architecture, which might contribute to intrafamilial phenotypic variability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,907
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle