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Enregistrement W3084283335 · doi:10.1016/j.str.2020.08.008

NMR Structure and Dynamics Studies of Yeast Respiratory Supercomplex Factor 2

2020· article· en· W3084283335 sur OpenAlexafffund
Shu Zhou, Pontus Pettersson, Jingjing Huang, Peter Brzezinski, Régis Pomès, Lena Mäler, Pia Ädelroth

Notice bibliographique

RevueStructure · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesHospital for Sick ChildrenNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEuropean CommissionGöteborgs UniversitetHorizon 2020 Framework ProgrammeKnut och Alice Wallenbergs StiftelseVetenskapsrådetCompute Canada
Mots-clésDimerChemistryHelix (gastropod)CrystallographyHydrogen bondHemeProtein structureMolecular dynamicsMicelleStereochemistryBiophysicsBiochemistryMoleculeBiologyEnzymeComputational chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

and cytochrome c oxidase. We previously demonstrated that Rcf2 forms a dimer in dodecylphosphocholine micelles, and here we report the solution NMR structure of this Rcf2 dimer. Each Rcf2 monomer has two soluble α helices and five putative transmembrane (TM) α helices, including an unexpectedly charged TM helix at the C terminus, which mediates dimer formation. The NOE contacts indicate the presence of inter-monomer salt bridges and hydrogen bonds at the dimer interface, which stabilize the Rcf2 dimer structure. Moreover, NMR chemical shift change mapping upon lipid titrations as well as molecular dynamics analysis reveal possible structural changes upon embedding Rcf2 into a native lipid environment. Our results contribute to the understanding of respiratory supercomplex formation and regulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,506

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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