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Enregistrement W3084307842 · doi:10.1681/asn.2020030286

Extracellular Matrix Injury of Kidney Allografts in Antibody-Mediated Rejection: A Proteomics Study

2020· article· en· W3084307842 sur OpenAlexafffund
Sergi Clotet‐Freixas, Caitríona M. McEvoy, Ihor Batruch, Chiara Pastrello, Max Kotlyar, Julie A.D. Van, Madhurangi Arambewela, Alex Boshart, Sofia Farkona, Yun Niu, Yanhong Li, Olusegun Famure, Andrea Božović, Vathany Kulasingam, Peixuen Chen, S. Joseph Kim, Emilie Chan, Sajad Moshkelgosha, Syed A. Rahman, Jishnu Das, Tereza Martinu, S. Juvet, Igor Jurišica, Andrzej Chruscinski, Rohan John, Ana Konvalinka

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCanada Foundation for InnovationKidney Foundation of CanadaToronto General and Western Hospital Foundation
Mots-clésExtracellular matrixKidneyProteomicsMedicineAntibodyPathologyImmunologyChemistryBiologyCell biologyInternal medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Statement Antibody-mediated rejection (AMR) accounts for more than 50% of kidney allograft loss. It arises from donor-specific antibodies against HLA antigens, which induce maladaptive responses in the glomeruli and tubulointerstitium. An unbiased proteomics analysis of laser-captured/microdissected glomeruli and tubulointerstitium from 30 indication kidney biopsy specimens with early AMR, acute cellular rejection, or acute tubular necrosis, quantified >2000 proteins in each compartment. Basement membrane and extracellular matrix (ECM) proteins were significantly decreased in both AMR compartments. Two ECM-modifying proteins, galectin-1 (LGALS1) and glutathione S-transferase ω -1 (GSTO1), were significantly increased in glomeruli and tubulointerstitium, respectively. Anti-HLA antibodies or AMR-related cytokines upregulated LGALS1 and GSTO1 in primary kidney cells, and may represent therapeutic targets to ameliorate ECM remodeling in AMR. Background Antibody-mediated rejection (AMR) accounts for >50% of kidney allograft loss. Donor-specific antibodies (DSA) against HLA and non-HLA antigens in the glomeruli and the tubulointerstitium cause AMR while inflammatory cytokines such as TNF α trigger graft injury. The mechanisms governing cell-specific injury in AMR remain unclear. Methods Unbiased proteomic analysis of laser-captured and microdissected glomeruli and tubulointerstitium was performed on 30 for-cause kidney biopsy specimens with early AMR, acute cellular rejection (ACR), or acute tubular necrosis (ATN). Results A total of 107 of 2026 glomerular and 112 of 2399 tubulointerstitial proteins was significantly differentially expressed in AMR versus ACR; 112 of 2026 glomerular and 181 of 2399 tubulointerstitial proteins were significantly dysregulated in AMR versus ATN ( P <0.05). Basement membrane and extracellular matrix (ECM) proteins were significantly decreased in both AMR compartments. Glomerular and tubulointerstitial laminin subunit γ -1 (LAMC1) expression decreased in AMR, as did glomerular nephrin (NPHS1) and receptor-type tyrosine-phosphatase O (PTPRO). The proteomic analysis revealed upregulated galectin-1, which is an immunomodulatory protein linked to the ECM, in AMR glomeruli. Anti-HLA class I antibodies significantly increased cathepsin-V (CTSV) expression and galectin-1 expression and secretion in human glomerular endothelial cells. CTSV had been predicted to cleave ECM proteins in the AMR glomeruli. Glutathione S-transferase ω -1, an ECM-modifying enzyme, was significantly increased in the AMR tubulointerstitium and in TNF α -treated proximal tubular epithelial cells. Conclusions Basement membranes are often remodeled in chronic AMR. Proteomic analysis performed on laser-captured and microdissected glomeruli and tubulointerstitium identified early ECM remodeling, which may represent a new therapeutic opportunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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